Naukowcy z Washington University School of Medicine w St. Louis odkryli potencjalny nowy cel immunoterapii raka w elementach transpozycyjnych (TE), krótkich segmentach DNA, które mogą poruszać się po genomie.

W artykule „Analiza pan-rakowa identyfikuje antygeny specyficzne dla nowotworu pochodzące z elementów transpozycyjnych” opublikowane w Genetyka przyrodynaukowcy wykorzystali Atlas genomu raka (TCGA), bazę danych zawierającą ponad 20 000 próbek raka obejmujących 33 różne typy raka i 675 linii komórek nowotworowych.

Artykuł koncentruje się na elementach transpozycyjnych (TE), które istnieją w ludzkim genomie, ale często są uśpione. Są to, jak sama nazwa wskazuje, segmenty DNA, które mogą wstawiać się do innych genów. Klasycznym przykładem jest retrowirus, który zawiera część swojego kodu genetycznego w genomie gospodarza. Genom jest przygotowany na tego rodzaju wtargnięcie, a kontynuacja replikacji i insercji jest zwykle „wyłączona”.

Kiedy nowotwory się rozwijają, robią to bez wielu normalnych genetycznych zabezpieczeń, ponieważ często pochodzą z komórek, które na początku mają uszkodzone DNA. Podczas replikacji rak pozwala tym uśpionym TE odzyskać zdolność transpozycji w komórkach nowotworowych i, zgodnie z badaniem, „napędza ekspresję nietypowych transkryptów, które czasami mogą być zarówno silnie eksprymowane, jak i szeroko rozpowszechnione w próbkach guza”.

Z tego powodu naukowcom udało się znaleźć TE wbudowane w 98% guzów różnych typów i odkryli, że „te transkrypty mają potencjał do wytwarzania nowych peptydów, które nie są obecne w łagodnych tkankach”, co sugeruje nowy sposób celowania w nowotwory, w różnych typach raka.

W badaniu zidentyfikowano 1068 kandydatów TE specyficznych dla nowotworu, którzy mogą generować wspólne specyficzne dla nowotworu chimeryczne antygeny TE (TS-TEA). Obecnie istnieją terapie przeciwnowotworowe ukierunkowane na określone typy antygenów i potrzebne są dalsze badania, aby potwierdzić, że ten szlak można wykorzystać do atakowania komórek nowotworowych za pomocą tych TS-TEA.

Medycyna zawsze działa w małych, iteracyjnych krokach odkrywania, prowadzących do pełnych zastrzeżeń potencjalnych ścieżek do wymyślenia lekarstwa. Różnica polega na tym, że wiele z tych ścieżek prowadzących do wyleczenia zostało już pokonanych.

Obecne badanie odkryło mechanizm w obrębie guzów, który tworzy możliwe cele dla istniejących metod leczenia. To odkrycie może prowadzić do nowych podejść terapeutycznych do leczenia raka i istnieje silna sugestia, że ​​dzięki dalszym badaniom można by opracować jeden rodzaj leczenia, który poradziłby sobie z wieloma typami raka w całym ciele.