System zgłaszania chorób świń jest zarządzany przez wykładowców i doktorantów ISU w zakresie weterynaryjnej diagnostyki i medycyny zwierząt produkcyjnych, w tym od lewej profesor nadzwyczajny Daniel Linhares, doktorant Guilherme Cezar i adiunkt naukowy Giovani Trevisan, w laboratorium wewnątrz Weterynaryjnego Laboratorium Diagnostycznego. Zdjęcie: Christopher Gannon/Iowa State University. Większy obraz.

AMES, Iowa – Po pionierskim systemie poprawy zdrowia świń poprzez gromadzenie i publikowanie wyników testów na patogeny z dużych publicznych laboratoriów weterynaryjnych na Środkowym Zachodzie, zespół kierowany przez wykładowców z College of Veterinary Medicine na Uniwersytecie Stanu Iowa planuje drążyć jeszcze głębiej, aby zebrać więcej wgląd z ogromnego zestawu danych.

Dane podstawowe

Dzięki grantowi z Centrum Informacji o Zdrowiu Świń (SHIC), system zgłaszania chorób świń (SDRS) został założony sześć lat temu przez dr. . Celem było zebranie i przeanalizowanie danych testowych z weterynaryjnych laboratoriów diagnostycznych w celu wykrycia pojawiających się trendów chorobowych, zapewniając producentom system wczesnego ostrzegania w celu szybkiego reagowania zapobiegawczego, takiego jak zwiększenie monitorowania i zwiększenie środków bezpieczeństwa biologicznego.

„SDRS zapewnia te fundamentalne dane, aby edukować branżę na temat aktywności patogenów w populacjach świń” – powiedział. „Po raz pierwszy jest systematyczny i szeroko relacjonowany. To naprawdę kwestia wiedzy o tym, co tam jest i zrozumienia, że ​​nie jesteś w ciemności”.

Inicjatywa rozpoczęła się od laboratoriów w stanie Iowa i University of Minnesota, gromadzących dane testowe dla jednego patogenu. Obecnie konsorcjum liczy pięciu członków – w tym państwowe laboratorium w Ohio oraz laboratoria na Uniwersytecie Stanowym Dakoty Południowej i Uniwersytecie Stanowym Kansas – i śledzi siedem patogenów, z podziałem na lokalizację, wiek, typ gospodarstwa i typ okazu. Anonimowe dane służą do wykrywania makrotrendów i nie można ich powiązać z konkretnymi producentami ani laboratoriami.

Dane i analizy są udostępniane co miesiąc za pośrednictwem internetowego pulpitu nawigacyjnego i podcastu prowadzonego przez Linharesa i dr Giovaniego Trevisana, adiunkta ds. badań weterynaryjnej diagnostyki i medycyny zwierząt produkcyjnych w stanie Iowa. SHIC, organizacja branżowa finansowana z kontroli wieprzowiny, której zadaniem jest monitorowanie chorób świń, zapewnia SDRS bieżące finansowanie operacyjne i publikuje miesięczny raport i biuletyn zawierający dane. Dyrektor wykonawczy SHIC, dr Paul Sundberg, powiedział, że pięć laboratoriów SDRS obsługuje co najmniej 96% testów diagnostycznych świń w USA, co sprawia, że ​​ich zagregowane dane są bardzo interesujące dla branży.

„Daje producentom, praktykom i innym zainteresowanym stronom aktualne informacje o regionalnym przemieszczaniu się chorób i ryzyku, które pomagają im zarządzać zdrowiem własnych stad” – powiedział Sundberg.

Kopać głębiej

Przy prawie 73 milionach świń w USA dane testowe zebrane przez SDRS są znaczące – ponad 530 000 indywidualnych wyników w 2022 r., powiedział Trevisan. Nowy trzyletni grant w wysokości 1 miliona dolarów od Narodowego Instytutu Wyżywienia i Rolnictwa (NIFA) Departamentu Rolnictwa USA pomoże zespołowi SDRS i współpracownikom rozszerzyć sposób wykorzystania tych informacji.

„Dzięki dotacji będziemy głębiej analizować dane, aby zapewnić producentom jeszcze większą wartość” — powiedział Trevisan, dyrektor ds. projektorów ubiegający się o nagrodę NIFA.

Finansowanie NIFA wesprze zaawansowaną analizę genetyczną w celu identyfikacji nowych odmian patogenów w miarę ich rozwoju, wykorzystując to, co według Trevisana jest jedną z największych znanych prywatnych kolekcji danych o chorobach genetycznych. Zapewni to jeszcze wcześniejsze ostrzeżenia o nowych zagrożeniach dla zdrowia świń.

„Będziemy nadal widzieć nowe szczepy, po prostu nie wiemy gdzie i kiedy. Chcemy być przed nim, gdy nadejdzie następny” – powiedział Linhares.

Trevisan powiedział, że rozszerzona analiza danych pomoże również ustalić, czy istnieją obszary geograficzne, w których SDRS powinien szukać więcej informacji. Zestaw danych może mieć inne nowatorskie zastosowania. Część grantu obejmuje kształcenie studentów medycyny weterynaryjnej i doktorantów innych dziedzin w zakresie wyników badań SDRS, zachęcanie ich do wykorzystywania ich do prowadzenia badań opartych na danych lub usprawniania procesu decyzyjnego w gospodarstwie.

„Chcemy wykorzystać wiedzę, którą budowaliśmy od 2017 roku, i przekazać ją studentom, aby pomóc społeczeństwu” — powiedział Trevisan.

Dotacja pozwoli również dopracować sposób udostępniania producentom danych dotyczących tendencji chorobowych. Eksperci SDRS spotkają się z hodowcami trzody chlewnej i innymi partnerami branżowymi, aby zbadać możliwe ulepszenia w sposobie przekazywania informacji.

„To droga dwukierunkowa. Nie tylko my pobieramy informacje dla producentów i interesariuszy z branży. Chcemy ich opinii” – powiedział Linhares.