Historycznie uważane za pasożyty genomowe, elementy transpozycyjne (TE) zostały obecnie uznane za istotne czynniki wpływające na tożsamość i funkcjonowanie komórek, zwłaszcza w regulacji odporności.

Genomy ssaków zawierają ogromną liczbę TE. Różnorodność i obfitość tych elementów wpływa na strukturę, funkcję i ewolucję genomu. Wpływają na sieci regulacyjne genów, zmieniając miejsca wiązania czynników transkrypcyjnych i tworząc nowe działania wzmacniające. Coraz częściej pojawiają się dowody podkreślające kluczową rolę TE w różnych chorobach, zwłaszcza w modulowaniu odporności. Jednakże w kontekście zapalenia mięśnia sercowego zauważalny jest brak skupienia się na wpływie TE, co podkreśla potencjalny obszar badań, który mógłby dostarczyć nowych informacji na temat mechanizmów molekularnych powodujących tę chorobę serca.

W badaniu opublikowanym w czasopiśmie KeAi Rozmnażanie i hodowlazespół naukowców z Hunan Normal University wykorzystał dane dotyczące RNA-Seq i jednokomórkowych RNA-Seq w celu zidentyfikowania kluczowych TE związanych z zapaleniem mięśnia sercowego.

Zespół wykorzystał publicznie dostępne bazy danych do zbadania roli TE w zapaleniu mięśnia sercowego. Przeanalizowano dane dotyczące sekwencji RNA i dane dotyczące sekwencjonowania pojedynczych komórek, ze szczególnym uwzględnieniem mysiego modelu eksperymentalnego autoimmunologicznego zapalenia mięśnia sercowego (EAM). Analiza RNA-Seq ujawniła znaczną regulację w górę szeregu genów odpornościowych w tkance serca.

„Pogłębiliśmy badania, wykorzystując sekwencjonowanie pojedynczych komórek komórek odpornościowych serca, i zidentyfikowaliśmy specyficzną ekspresję pewnych elementów transpozycyjnych (TE) w różnych typach komórek odpornościowych serca” – mówi pierwszy autor badania, Sixing Chen. „Zaobserwowaliśmy ogólny wzrost ekspresji ERVB7-1”.

Transpozon LTR-MM w różnych komórkach w modelu EAM sugeruje powszechny wpływ tego transpozonu na odpowiedź immunologiczną w kontekście tej choroby.

„Nasze odkrycia podkreślają złożoną interakcję między TE a układem odpornościowym w kardiomiopatii, dostarczając nowego wglądu w mechanizmy molekularne leżące u podstaw tej choroby” – dodaje Chen.

W szczególności odkrycie specyficznej ekspresji TE w komórkach odpornościowych serca i ogólny wzrost ERVB7-1. Ekspresja LTR-MM w modelu EAM podkreśla potencjał tych elementów w modulowaniu odpowiedzi immunologicznych i przyczynia się do zrozumienia patogenezy kardiomiopatii. Obserwacje te otwierają możliwości dalszych badań nad rolą TE w chorobach serca, optymalizując nowe strategie terapeutyczne.

###

Skontaktuj się z autorem: Yuequn Wang, Centrum Rozwoju Serca, Państwowe Kluczowe Laboratorium Biologii Rozwojowej Ryb Słodkowodnych, College of Life Sciences, Hunan Normal University, yuequnwang@hunnu.edu.cn

Wydawnictwo KeAi zostało założone przez Elsevier i China Science Publishing & Media Ltd w celu rozwijania badań jakości na całym świecie. W 2013 roku skupiliśmy się na publikacjach w otwartym dostępie. Obecnie z dumą publikujemy ponad 100 światowej klasy anglojęzycznych czasopism o otwartym dostępie, obejmujących wszystkie dyscypliny naukowe. Wiele z nich to tytuły, które publikujemy we współpracy z prestiżowymi stowarzyszeniami i instytucjami akademickimi, takimi jak Chińska Narodowa Fundacja Nauk Przyrodniczych (NSFC).