Identyfikacja nowych wariantów genetycznych związanych z niewydolnością serca
![Identyfikacja nowych wariantów genetycznych związanych z niewydolnością serca](https://oen.pl/wp-content/uploads/2023/01/identifying-new-geneti-770x470.jpg)
![Powiązania całego genomu z niewydolnością serca. Wyniki metaanalizy wielopochodnej GWAS dotyczącej niewydolności serca z jakiejkolwiek przyczyny, przeprowadzonej przy użyciu modelu ważonego odwrotną wariancją o ustalonym efekcie. Wykres Manhattanu znaczących (p-8) powiązań w całym genomie. Każdy punkt reprezentuje wariant genetyczny. Warianty zaznaczone na czerwono znajdują się +/- 500 kb znaczącego locus w całym genomie. Oś x reprezentuje pozycję genomową, a oś y przedstawia siłę asocjacji reprezentowaną przez -log 10 (wartość p). Geny kandydujące B zostały przypisane do każdego znaczącego wariantu w całym genomie (p-8) w analizach dotyczących wielu przodków i specyficznych dla przodków (w oparciu o bliskość najbliższego miejsca startu transkrypcji). Geny kandydujące są pogrupowane według chromosomów. Wcześniej niezgłoszone geny kandydujące (> 500 kb z wcześniej zgłoszonego locus) są oznaczone gwiazdkami. Rozmiar każdego punktu odpowiada sile powiązania reprezentowanej przez −log 10 (wartość p). Tam, gdzie wiele niezależnych wariantów zmapowano na ten sam gen, pokazano tylko najsilniejsze powiązanie. Źródło: Nature Communications (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-34216-6″ width=”800″ height=”300″/><figcaption class= Identyfikacja nowych wariantów genetycznych związanych z niewydolnością serca](https://oen.pl/wp-content/uploads/2023/01/1673280789_551_Identyfikacja-nowych-wariantow-genetycznych-zwiazanych-z-niewydolnoscia-serca.jpg)
Powiązania całego genomu z niewydolnością serca. Wyniki metaanalizy wielopochodnej GWAS dotyczącej niewydolności serca z jakiejkolwiek przyczyny, przeprowadzonej przy użyciu modelu ważonego odwrotną wariancją o ustalonym efekcie. Działka Manhattan o znaczeniu dla całego genomu (p <5 × 10−8) skojarzenia. Każdy punkt reprezentuje wariant genetyczny. Warianty zaznaczone na czerwono znajdują się +/- 500 kb znaczącego locus w całym genomie. Oś x reprezentuje pozycję genomową, a oś y przedstawia siłę asocjacji reprezentowaną przez −log10(wartość p). Geny kandydujące B zostały przypisane do każdego istotnego wariantu w całym genomie (p <5 × 10−8) w analizach dotyczących wielu przodków i specyficznych dla przodków (w oparciu o bliskość najbliższego miejsca startu transkrypcji). Geny kandydujące są pogrupowane według chromosomów. Wcześniej niezgłoszone geny kandydujące (> 500 kb z wcześniej zgłoszonego locus) są oznaczone gwiazdkami. Rozmiar każdego punktu odpowiada sile skojarzenia reprezentowanej przez −log10(wartość p). Tam, gdzie wiele niezależnych wariantów zmapowano na ten sam gen, pokazano tylko najsilniejsze powiązanie. Kredyt: Komunikacja natury (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-34216-6
Naukowcy zidentyfikowali nowe warianty genetyczne związane z niewydolnością serca, wynika z badań opublikowanych w czasopiśmie Komunikacja natury.
Badanie, w którym przeanalizowano genomy i przodków ponad 115 000 pacjentów z niewydolnością serca, wyszczególnia 47 loci ryzyka w ludzkim genomie, w których warianty genetyczne mogą wskazywać na zwiększone ryzyko niewydolności serca. Ponadto badacze zidentyfikowali dziewięć krążących białek związanych z niewydolnością serca lub specyficznymi ilościowymi cechami obrazowania.
Odkrycie podkreśla znaczenie powszechnych zmienności genetycznych w patogenezie niewydolności serca, powiedziała dr Megan Roy-Puckelwartz, adiunkt na Wydziale Farmakologii i współautorka badania.
„To badanie otwiera nowe sposoby myślenia o niewydolności serca” – powiedział Puckelwartz. „Te loci stają się teraz celem leczenia, a ponieważ pokazujemy również siłę związku między niewydolnością serca a tymi cechami obrazowania kardiometabolicznego, możemy wykorzystać je jako markery do określenia czyjegoś ryzyka niewydolności serca”.
Centrum Kontroli i Prewencji Chorób szacuje, że prawie 6,2 miliona Amerykanów cierpi na jakąś formę niewydolności serca, co oznacza, że serce nie może pompować wystarczającej ilości krwi, aby utrzymać organizm, ale serce nie przestaje całkowicie bić.
Niewydolność serca jest powszechna, a rola genetyki w tym stanie jest złożona. Przed tym badaniem zidentyfikowano tylko 11 wspólnych loci ryzyka niewydolności serca za pomocą asocjacji całego genomu, metody badawczej, która łączy warianty genetyczne w całym genomie z niewydolnością serca.
Aby lepiej zrozumieć powiązania między genami a niewydolnością serca, autorzy badania przeprowadzili metaanalizę badań asocjacyjnych obejmujących cały genom niewydolności serca i objęli ponad 1,6 miliona kontroli o różnym pochodzeniu genetycznym.
Następnie badacze porównali nowo zidentyfikowane genetyczne warianty ryzyka z innymi cechami kardiometabolicznymi, w tym migotaniem przedsionków, wskaźnikiem masy ciała, chorobą wieńcową, ciśnieniem krwi i poziomem cholesterolu. Odkryli, że warianty ryzyka niewydolności serca były związane z podwyższonym ciśnieniem krwi i chorobą wieńcową.
Na koniec autorzy badania przeprowadzili analizę randomizacji mendlowskiej 725 ludzkich białek i stwierdzili, że dziewięć z nich było powiązanych z wariantami ryzyka niewydolności serca.
„To badanie jest ważne ze względu na wielkość i zakres populacji z niewydolnością serca, które w nim uczestniczyły” – powiedziała dr Elizabeth McNally, profesor medycyny genetycznej Elizabeth J. Ward i współautorka badania. „Dzięki ocenie tak dużej liczby pacjentów z niewydolnością serca udało się znaleźć nowe geny i białka związane z niewydolnością serca”.
Powiedziała, że niektóre geny i białka będą przydatne do przewidywania, kto jest zagrożony rozwojem niewydolności serca, a także mogą służyć jako przyszłe cele leczenia.
„Mamy nadzieję, że uda nam się wykorzystać te obserwacje i zintegrować rzadkie zmiany genów z tego rodzaju„ powszechnymi ”wariantami genów, abyśmy mogli lepiej przewidzieć, kto prawdopodobnie rozwinie niewydolność serca, a u kogo mogą wystąpić powikłania arytmii” – powiedział McNally , który jest jednocześnie dyrektorem Centrum Medycyny Genetycznej.
Michael G. Levin i wsp., Analiza asocjacji całego genomu i analiza wielu cech charakteryzująca wspólną architekturę genetyczną niewydolności serca, Komunikacja natury (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-34216-6
Dostarczone przez Northwestern University
Cytat: Identyfikacja nowych wariantów genetycznych związanych z niewydolnością serca (2023, 9 stycznia) pobrana 9 stycznia 2023 z
Niniejszy dokument podlega prawu autorskiemu. Poza wszelkimi uczciwymi transakcjami do celów prywatnych studiów lub badań, żadna część nie może być powielana bez pisemnej zgody. Ta zawartość jest w jedynie w celach informacyjnych.