Instytut Garvan i Illumina współpracują, aby ulepszyć leczenie złożonych chorób
Illumina, globalna firma zajmująca się genomiką i zdrowiem ludzkim, nawiązała współpracę z projektem TenK10K Instytutu Badań Medycznych Garvan, aby pomóc w transformacji leczenia złożonych chorób, począwszy od chorób autoimmunologicznych, przy wspólnej inwestycji o wartości 27 milionów dolarów australijskich.
Instytut Garvan planuje zmapować 50 milionów ludzkich komórek od 10 000 osób, aby zidentyfikować unikalne genomowe odciski palców chorób autoimmunologicznych, chorób serca i raka, opierając się na wczesnym sukcesie badania klinicznego dotyczącego choroby Leśniowskiego-Crohna.
Choroba Leśniowskiego-Crohna dotyka ponad 80 000 Australijczyków. Podobnie jak w przypadku wielu chorób autoimmunologicznych, przewidzenie, które leczenie będzie najskuteczniejsze dla poszczególnych pacjentów, jest obecnie niemożliwe. Badanie kliniczne OneK1K przeprowadzone w 10 szpitalach w Sydney pokazuje, że projekt genetycznych odcisków palców prowadzony przez Instytut Garvan może pomóc w dopasowaniu najskuteczniejszego leczenia poszczególnych pacjentów.
Illumina wspiera projekt dostawami, sprzętem i specjalistycznym wsparciem badawczym, co zapewni krytyczny impuls dla badań firmy Garvan nad sekwencjonowaniem pojedynczych komórek i całego genomu oraz umożliwi zwiększenie skali projektu TenK10K, dzięki czemu stanie się on największym projektem tego typu. Inwestycja umożliwi Instytutowi Garvana poprawę dokładności identyfikacji i opracowania odcisków palców komórek odpornościowych powiązanych z chorobą:
- Komercyjne testy w celu określenia właściwej terapii trudnych chorób autoimmunologicznych, w tym stwardnienia rozsianego, reumatoidalnego zapalenia stawów, tocznia, cukrzycy typu 1, zapalenia stawów kręgosłupa, choroby zapalnej jelit i choroby Leśniowskiego-Crohna
- Wczesne próby nowych, potężnych terapii RNA
- Potencjalne wczesne cele w leczeniu nowotworów i długiego przebiegu Covid-19
- Testy śledzące następstwa zawału serca i identyfikujące ryzyko nagłej śmierci.
Praca ta ma potencjał, aby umożliwić znaczący krok naprzód w medycynie spersonalizowanej. W 2022 roku w artykule w Naukaogłosiliśmy, że przeanalizowaliśmy profil genomowy ponad miliona komórek od 1000 osób w celu zidentyfikowania markerów chorób autoimmunologicznych. Udało nam się tego dokonać za pomocą sekwencjonowania pojedynczych komórek – nowej technologii, która pozwala nam wykryć subtelne zmiany w poszczególnych komórkach”.
Profesor Joseph Powell, lider projektu OneK1K, a obecnie TenK10K w Garvan Institute of Medical Research
„Doprowadziło to do sprawdzenia zasad badania klinicznego w 10 szpitalach w Sydney, aby sprawdzić, czy możemy ulepszyć leczenie choroby Leśniowskiego-Crohna. Wczesne wyniki sugerują, że możemy przewidzieć reakcję pacjenta na terapię na podstawie jego profilu genetycznego. sekwencjonowania komórek, które analizuje pojedyncze komórki, a nie średnią z wielu komórek, możemy zobaczyć odciski palców, których nigdy wcześniej nie byliśmy w stanie rozróżnić”.
„Teraz, z pomocą Illumina, TenK10K wykorzysta te prace do wygenerowania danych dotyczących pojedynczych komórek na temat około 50 milionów komórek od 10 000 osób, aby jeszcze bardziej poprawić dokładność przewidywania ryzyka choroby i odpowiedzi na leczenie. Badania te pomogą zidentyfikować subtelne genomy różnic między komórkami każdego człowieka, co pomoże nam przyspieszyć diagnozowanie i leczenie wielu chorób. Jesteśmy podekscytowani możliwościami translacyjnymi, jakie dają połączenie tego wiodącego na świecie zasobu biotechnologicznego z zaawansowanymi metodami uczenia maszynowego” – mówi profesor Powell.
Minister badań medycznych Nowej Południowej Walii, David Harris, pogratulował Garvan Institute of Medical Research i Illumina tego wyjątkowego partnerstwa.
„To partnerstwo pomoże rozwinąć dziedzinę genomiki i medycyny spersonalizowanej, zapewniając korzyści pacjentom w całej Nowej Południowej Walii” – powiedział Harris.
„Przyszłość tych prac umożliwi sekwencjonowanie danych genomowych pacjentów nowej generacji, aby zapewnić im bardziej spersonalizowane leczenie chorób przewlekłych i autoimmunologicznych.
„NSW ma długą historię inwestowania w przełomowe badania genomiczne. Nowe partnerstwa oparte na współpracy, takie jak to, są niezbędne, aby zapewnić, że NSW nadal będzie światowym liderem w dostarczaniu najnowocześniejszych i prawdziwie przekładających się badań, które pomogą sprostać wyzwaniom i potrzebom przyszłą opiekę zdrowotną.”
„Przez następne dwanaście lat musiałem radzić sobie z niezliczoną liczbą wizyt lekarskich i specjalistycznych, badaniami krwi, tomografią, kolonoskopią, wizytami w nagłych przypadkach, długimi pobytami w szpitalu i niezliczoną ilością stale zmieniających się leków doustnych i dożylnych. Po wyczerpaniu wszystkich możliwości związanych z lekami spędziłem w ciągu najbliższych pięciu lat przejdzie cztery poważne operacje”.
„Teraz w końcu pozbyłem się tej choroby, chociaż przez resztę życia będę musiał zmagać się z jej skutkami i możliwością jej powrotu”.
„Jestem podekscytowana wiadomością, jak Joseph i jego zespół pracują nad szybszym uzyskiwaniem odpowiedzi i szybszym leczeniem” – mówi.
Profesor Benjamin Kile, dyrektor wykonawczy Instytutu Garvan, mówi: „To partnerstwo jest świadectwem wiodących na świecie badań prowadzonych w Garvan, wykorzystujących naszą wyjątkową wiedzę specjalistyczną na frontach klinicznych i badawczych. To innowacyjne badanie ma zmienić opiekę nad pacjentami niektórych z najtrudniejszych do wyleczenia chorób.”
„Kilka lat temu ten projekt byłby niemożliwy” – mówi Simon Giuliano z Illuminy, dyrektor handlowy Oceanii. „Teraz dysponujemy technologią umożliwiającą szybkie i tanie wykrywanie różnic w genomice poszczególnych komórek za pomocą sekwencjonowania nowej generacji. A to otwiera potencjał nowej ery spersonalizowanego zdrowia, w której zmienność w każdej komórce ludzkiej wskazuje na właściwe leczenie na indywidualną chorobę, unikając prób i błędów w przeszłości.”
Źródło:
Instytut Badań Medycznych Garvana
