Nauka i technika

Mutacja genetyczna, która sprawia, że ​​„Kraken” Covid jest tak zaraźliwy

  • 16 stycznia, 2023
  • 6 min read
Mutacja genetyczna, która sprawia, że ​​„Kraken” Covid jest tak zaraźliwy


Nowy szczep koronawirusa – Źródło: Olga Siletskaya/Getty iStock/Getty Images

Nowy szczep koronawirusa – Źródło: Olga Siletskaya/Getty iStock/Getty Images

Jest nowy, bardziej zaraźliwa postać nowego koronawirusa. Ma większą zdolność unikania naszych przeciwciał. I rozprzestrzenia się łatwiej niż kiedykolwiek.

Czytałeś już te słowa i prawie na pewno przeczytasz je ponownie, gdy pandemia Covid wkroczy w czwarty rok kalendarzowy. Ale uważaj, ponieważ jest coś nowego w XBB.1.5, znanym również jako Kraken, najnowszy podwariant Omicron, który szybko staje się dominującą formą SARS-CoV-2 w większości krajów świata. XBB.1.5 ewoluował po kilku duża genetyczne zwroty akcji.

Więcej z Rolling Stone

Wirus wciąż może nas zaskoczyć. A to może oznaczać tylko jedno: „Wygląda na to, że SARS-CoV-2 będzie z nami przez długi czas” – mówi Matthew Frieman, immunolog i mikrobiolog z University of Maryland School of Medicine.

Kraken zawiera kluczową mutację, którą genetycy nazywają „F486P”. To pozornie niewielka zmiana w białku kolca, części wirusa, która pomaga mu złapać się i zainfekować nasze komórki. F486P działa poprzez zwiększenie zdolności kolca do „wiązania” z jedną określoną częścią naszych komórek zwaną receptorem ACE2. Ta niewielka zmiana ma ogromne konsekwencje. F486P pozwala XBB.1.5 zachować wszystkie najniebezpieczniejsze cechy jego nadrzędnych wariantów podrzędnych, jednocześnie dodając Nowy jakość: ekstremalna przenośność.

Zasadniczo F486P sprawia, że ​​XBB.1.5 jest naprawdę bardzo zaraźliwy — znacznie bardziej zaraźliwy niż jego bezpośredni poprzednicy. Ale odziedziczył również po tych samych poprzednikach alarmujący potencjał unikania naszych przeciwciał. „Ze względu na mutację kolczastą F486P, XBB.1.5 wykazuje znacznie wyższe powinowactwo wiązania z receptorem wirusowym… podczas gdy zachowuje podobne unikanie przeciwciał [properties]”, mówi Lihong Liu, badacz Covid Covid z Columbia University. Krótko mówiąc, XBB.1.5 jest pierwszym wariantem podrzędnym w swojej najbliższej rodzinie, który jest zarówno bardziej odporny na unikanie odporności oraz bardziej zaraźliwy.

Warto przeczytać!  Nowy podcast SWaB: Ciemna energia i kosmiczny wzrost

Pojawienie się mutacji F486P jest przypomnieniem, że choć wielu ludzi żyje dalej, pandemia jeszcze się nie skończyła. Wirus wciąż znajduje sposoby na szybsze rozprzestrzenianie się, jednocześnie coraz bardziej przemykając obok wszystkich tych przeciwciał, które zbudowaliśmy ze szczepionek, dawek przypominających i wcześniejszych infekcji.

XBB.1.5 po raz pierwszy pojawił się w próbkach wirusa w północno-wschodnich Stanach Zjednoczonych w październiku. Dwa miesiące później jest obecny w prawie 30 krajach i według najnowszych prognoz amerykańskich Centrów Kontroli i Prewencji Chorób może już być dominującą postacią Covid-19 w Stanach Zjednoczonych. Nieprzypadkowo nastąpił gwałtowny wzrost liczby poważnych przypadków Covid w północno-wschodnich Stanach Zjednoczonych, miejscu narodzin XBB.1.5 i regionie, w którym powietrze jest najgęstsze.

Oczywiście, przechodziliśmy już przez coś takiego. Jakiś nowy wariant podrzędny ewoluuje, staje się dominujący i napędza gwałtowny wzrost liczby przypadków. Ale do tej pory większość ludzi w większości krajów ma zdrową mieszankę przeciwciał Covid ze szczepionek, przebytej infekcji lub obu. Tak więc, podczas gdy wskaźniki infekcji rosną i spadają zgodnie z rytmem ewolucji wirusów, hospitalizacje i zgony od wielu miesięcy mają tendencję spadkową w większości krajów świata.

Warto przeczytać!  Dlaczego lubimy zwroty w Fulgent Genetics (NASDAQ:FLGT)

Nie ma powodu, by oczekiwać, że XBB.1.5 znacząco zmieni tę dynamikę. Mimo wszystkich nowych zmarszczek genetycznych, to wciąż Omicron. Pomiędzy szczepionkami, dawkami przypominającymi i odpornością na wcześniejsze infekcje mamy wiele sposobów ochrony przed tym konkretnym wariantem i jego potomstwem.

Jeśli jest duży wyjątek, to są to Chiny, gdzie trzyletnia blokada w końcu zaczęła się znosić na początku grudnia po powszechnych protestach społecznych. Teraz chiński system opieki zdrowotnej ugina się pod wpływem pierwszej dużej, ogólnokrajowej epidemii Covid-19. Warto zauważyć, że XBB.1.5 nie pojawił się w Chinach. Już.

Większość świata jest w całkiem dobrej sytuacji, aby przejść przez XBB.1.5. Chiny nie. Dla wielu setek milionów Chińczyków o słabszej odporności ewolucyjne zwroty akcji COVID są dość złowieszcze.

Zaczęło się od BA.2 i BA.2.75, dwóch wczesnych wariantów podrzędnych Omicron, które dominowały w wielu krajach odpowiednio zeszłej wiosny i lata. W pewnym momencie ktoś — lub kilka osób — które wyzdrowiały z BA.2, złapał BA.2.75 lub odwrotnie. Dwie formy wirusa połączyły się w tych żywicielach, tworząc „rekombinowany” XBB, który później ewoluował w XBB.1, a następnie XBB.1.5.

Peter Hotez, ekspert w dziedzinie opracowywania szczepionek w Baylor College, opisuje te rekombinanty jako warianty „Scrabble”. „Ponieważ zwykle używają wartościowych liter Scrabble, takich jak X, B i Q”. To, co je wszystkie łączy, to to, że są „wariantami ucieczki domeny wiążącej się z receptorem” – mówi Hotez.

Mówiąc prostym językiem, mają lepkie białka kolczaste oraz są naprawdę dobrzy w unikaniu naszych przeciwciał, zwłaszcza przeciwciał, które otrzymujemy ze szczepionek. „W moim rozumieniu XBB.1, rodzic XBB.1.5, jest prawie całkowicie odporny na odporność humoralną wywołaną szczepionką” – mówi Kei Sato, wirusolog z Uniwersytetu Tokijskiego.

Warto przeczytać!  Rejestr pacjentów z chorobą Alzheimera podnoszący pytania, gdy lek OK się zbliża

Ale XBB.1.5 jest jeszcze bardziej lepki oraz bardziej wymijający. A to wszystko z powodu mutacji F486P. Oryginalny XBB i jego bezpośredni potomek XBB.1 zawierały F486S zamiast F486P. F486S zmienił białko szczytowe, ale nie sprawiają, że białko szczytowe jest bardziej lepkie, a tym samym bardziej podatne na przenoszenie.

Dzięki F486P, XBB i XBB.1 osiągnęły większe unikanie odporności bez dodając również większą przenośność. Potem pojawił się XBB.1.5 i przeciwstawił się temu pocieszającemu trendowi. Ulepszenie mutacji, z F486S do F486P, sprawiło, że białko szczytowe stało się bardziej lepkie, a wirus bardziej przenoszony.

Dla większości z nas ta innowacja genetyczna jest najbardziej niepokojąca ze względu na sygnalizowany przez nią trend. Na początku 2021 r. – zaledwie sześć miesięcy po wybuchu pandemii – pojawiły się spekulacje, że SARS-CoV-2 zabraknie przestrzeni genetycznej, że tak powiem, i przestanie mutować w znaczący sposób.

To się nie zdarzyło. „Wydaje się, że w genomie jest jeszcze więcej przestrzeni mutacyjnej” – mówi Frieman. XBB.1.5 jest dowodem na to, że wirus wciąż może się zmieniać, wciąż stawać się bardziej zaraźliwy i bardziej wymijający. Że po tylu latach wciąż może nas zaskakiwać.

Najlepsze z Rolling Stone’a

Kliknij tutaj, aby przeczytać cały artykuł.


Źródło