Naukowcy rozszyfrowują, w jaki sposób enzym modyfikuje materiał genetyczny w jądrze komórkowym
![Naukowcy rozszyfrowują, w jaki sposób enzym modyfikuje materiał genetyczny w jądrze komórkowym](https://oen.pl/wp-content/uploads/2024/04/researchers-decipher-h-770x470.jpg)
Prosty model jakościowo wyjaśnia obserwacje eksperymentalne. a, ISWI posiada dwie domeny oddziałujące z nukleosomami, które mogą łączyć sąsiadujące nukleosomy w gęstej chromatynie. b, Przedstawienie symulacji dynamiki molekularnej ISWI FRAP w kondensacie chromatyny. c Po lewej: uśrednione ślady ISWI FRAP w różnych warunkach nukleotydowych z sd pochodzącym z trzech powtórzeń. Po prawej: stałe szybkości symulowanych śladów FRAP. d, Reprezentacja symulowanych eksperymentów termojądrowych. e, Symulacje trzech niezależnych zdarzeń fuzyjnych dla każdego warunku nukleotydowego. Po lewej: uśrednione ślady syntezy z sd. Po prawej: względne prędkości syntezy symulowanych śladów. Kredyt: Przyroda Biologia strukturalna i molekularna (2024). DOI: 10.1038/s41594-024-01290-x
× zamknąć
Prosty model jakościowo wyjaśnia obserwacje eksperymentalne. a, ISWI posiada dwie domeny oddziałujące z nukleosomami, które mogą łączyć sąsiadujące nukleosomy w gęstej chromatynie. b, Przedstawienie symulacji dynamiki molekularnej ISWI FRAP w kondensacie chromatyny. c Po lewej: uśrednione ślady ISWI FRAP w różnych warunkach nukleotydowych z sd pochodzącym z trzech powtórzeń. Po prawej: stałe szybkości symulowanych śladów FRAP. d, Reprezentacja symulowanych eksperymentów termojądrowych. e, Symulacje trzech niezależnych zdarzeń fuzyjnych dla każdego warunku nukleotydowego. Po lewej: uśrednione ślady syntezy z sd. Po prawej: względne prędkości syntezy symulowanych śladów. Kredyt: Przyroda Biologia strukturalna i molekularna (2024). DOI: 10.1038/s41594-024-01290-x
Wewnątrz jądra komórkowego cząsteczka DNA znajduje się w gęsto upakowanym kompleksie DNA-białko, znanym jako chromatyna. Tutaj DNA jest owinięty wokół rdzenia białek histonowych i gęsto upakowany, tworząc nukleosomy. Struktura nukleosomów określa, które geny są dostępne i aktywne, dlatego odgrywa ważną rolę w regulacji genów. Aby odpowiedzieć na sygnały metaboliczne, zmienione warunki środowiskowe i procesy rozwojowe, nukleosomy muszą podlegać powtarzającym się dynamicznym modyfikacjom za pomocą enzymów.
Zespół kierowany przez profesora Johannesa Stiglera z Gene Center Monachium przy LMU we współpracy z Felixem Müller-Planitz (TU Dresden) przeprowadził obecnie badania w celu zbadania, w jaki sposób malutki enzym modyfikujący chromatynę zwany ISWI pozostaje mobilny pomimo gęsto upakowanego materiału w jądrze komórkowym i jest w stanie skutecznie zmieniać układ nukleosomów.
Praca publikowana jest w czasopiśmie Przyroda Biologia strukturalna i molekularna.
Naukowcom udało się wykazać, że enzym zużywa ATP – walutę energetyczną komórki – nie tylko ze względu na swoją aktywność enzymatyczną, ale także do poruszania się po jądrze komórkowym i zapobiegania nadmiernej sztywności chromatyny.
„Ruch ISWI przez przestrzeń gęsto wypełnioną chromatyną jest napędzany przez ATP. W miarę postępu łączy się on naprzemiennie z różnymi miejscami wiązania na nukleosomach. Porównujemy ten ruch z ruchem małpy skaczącej z gałęzi na gałąź” – mówi Stigler.
Zdaniem naukowców rozszyfrowanie tych procesów może dostarczyć wiedzy na temat tego, w jaki sposób defekty przyczyniają się do chorób, a nawet otworzyć nowe możliwości terapeutyczne.
Więcej informacji:
Petra Vizjak i wsp., ISWI katalizuje przesuwanie nukleosomów w skondensowanych układach nukleosomów, Przyroda Biologia strukturalna i molekularna (2024). DOI: 10.1038/s41594-024-01290-x
Informacje o czasopiśmie:
Przyroda Biologia strukturalna i molekularna