Naukowcy z Georgia Tech identyfikują nowe sieci genów powiązane z agresywnym typem raka piersi
![Naukowcy z Georgia Tech identyfikują nowe sieci genów powiązane z agresywnym typem raka piersi](https://oen.pl/wp-content/uploads/2024/04/john_mcdonald_0.png)
Rak piersi jest drugą najczęstszą diagnozą nowotworu u kobiet w USA i drugą najczęstszą przyczyną zgonów z powodu nowotworu u kobiet. W ostatnich latach metody leczenia raka piersi uległy znacznej poprawie dzięki celowanej terapii genowej i immunoterapii. Jednak w przypadku małej grupy pacjentek, u których zdiagnozowano najbardziej agresywny typ podstawnopodobny raka piersi, takie metody są mniej skuteczne.
Ostatnio naukowcy z Zintegrowane Centrum Badań nad Rakiem Georgia Tech (ICRC) odkryli, że ten konkretny rak piersi wykazuje unikalną interaktywną strukturę sieci genów. Korzystając z matematyki zwanej „teorią grafów”, która modeluje relacje między parą obiektów, naukowcy wykryli obliczeniowo zmiany w interakcjach gen-gen jako ten rak piersi pojawia się i rozwija.
„Odkrycie nowych sieci genów powiązanych z podstawnopodobnymi rakami piersi pomogło nam zidentyfikować potencjalne nowe cele genowe w leczeniu tego bardzo agresywnego rodzaju raka piersi” – mówi Johna McDonalda, dyrektor założyciel ICRC, emerytowany profesor Szkoły Nauk Biologicznych i autor korespondujący z badaniem. „Nie odkrylibyśmy tych możliwych metod leczenia wyłącznie poprzez analizę ekspresji genów”.
Podstawnopodobny rak piersi, choć powoduje zaledwie 10–20% rozpoznań raka piersi, jest znacznie bardziej agresywny niż inne podtypy – a jeśli nie zostanie wcześnie wykryty, można go wyleczyć chirurgicznie i/lub radioterapią, skutecznym leczeniem przeciwnowotworowym może być wyzwaniem. Podtyp podstawnopodobny nie reaguje na tradycyjne terapie hormonalne.
„Składniki każdego złożonego systemu, takiego jak ludzki genom, są z pewnością ważne” – powiedział McDonald. „Sposób, w jaki te niezależne komponenty współdziałają ze sobą, jest również krytyczny”.
Stwierdzono, że wiele genów tworzących te unikalne sieci jest zaangażowanych w funkcje niezwiązane wcześniej z rakiem piersi. Stephena Housleyabadacz neurobiologii w Szkole Nauk Biologicznych i współautor artykułu, zauważył, że „nieoczekiwanym i intrygującym wynikiem naszego badania jest to, że procesy nerwowe wydają się odgrywać znaczącą rolę w odróżnianiu wysoce agresywnych guzów podstawnopodobnych od mniej agresywne podtypy luminalne A i luminalne B.
Wyniki zespołu szczegółowo opisano w nowym artykule „Changes in Gene Network Interactions in Breast Cancer Onset and Development”, który ukazał się w numerze z kwietnia 2024 r GEN Biotechnologia. Na podstawie wyników tego badania i wcześniej opublikowanych analiz ośmiu innych typów nowotworów naukowcy uważają, że ustalili przydatność analizy sieciowej w identyfikowaniu potencjalnych nowych kandydatów do diagnozy i leczenia ukierunkowanej terapii genowej piersi i innych typów nowotworów. nowotwory.
Oprócz McDonalda, Housleya i Asharda, Kara Keun Lee, była doktor bioinformatyki. student, który pracował w laboratorium McDonald’s, jest także współautorem artykułu.
Przedstawione tutaj wyniki są w całości lub w części oparte na danych wygenerowanych przez sieć badawczą TCGA. Projekt Genotype-Tissue Expression (GTEx) był wspierany przez Fundusz Wspólny Biura Dyrektora Narodowych Instytutów Zdrowia oraz NCI, NHGRI, NHLBI, NIDA, NIMH i NINDS.
Badania te były wspierane przez stypendium studenckie Mark Light Integrated Cancer Research Center, fundusz Deborah Nash Endowment Fund, Northside Hospital (Atlanta) i Ovarian Cancer Institute (Atlanta).
Cytat: „Changes in Gene Network Interactions in Breast Cancer Onset and Development”, Zainab Arshad, Stephen N. Housley, Kara Keun Lee i John F. McDonald, GEN Biotechnology, kwiecień 2024 r.,
DOI: