Nauka i technika

Naukowcy: zmienność genów zwiększa ryzyko awarii

  • 19 czerwca, 2023
  • 4 min read
Naukowcy: zmienność genów zwiększa ryzyko awarii


Chociaż ich artykuł wciąż czeka na recenzję, grupa naukowców doszła do wniosku, że ich badanie wskazuje, że zmienność genu może przyczynić się do katastrofalnego ryzyka rozpadu u koni.

Zgodnie z preprintem z 18 czerwca w bioRxiv, który przedstawia się jako serwer preprint dla biologii, naukowcy odkryli, że funkcjonalny polimorfizm pojedynczego nukleotydu lub zmienność genu powyżej genu kolagenu typu III może przyczynić się do katastrofalnego ryzyka złamań u koni pełnej krwi angielskiej.

Streszczenie zawierało następujący wniosek: „To podejście zapewnia potężne środki do identyfikacji nowych wariantów DNA i zrozumienia ich mechanizmu działania, aby umożliwić rozwój nowych sposobów identyfikacji i leczenia koni o wysokim ryzyku katastrofalnego złamania”.

Pełny preprint zawierał bardziej szczegółowe wnioski.

„Podsumowując, stworzyliśmy system oparty na komórkach, który pozwala nam badać genetyczne podstawy złamań u koni pełnej krwi angielskiej. W ramach wsparcia wcześniejszych prac identyfikujących region związany ze złamaniami na ECA18 (Blott i in. 2014; Tozaki i in. 2020) wykazaliśmy, że jeden z genów w tym regionie, COL3A1, ulega zróżnicowanej ekspresji w komórkach koni o wysokim i niskim ryzyku złamania i że może to częściowo wynikać z obecności powiązanego SNP w promotorze COL3A1, „badanie wykazało. „SNP może wpływać na wiązanie SOX11 i wykazaliśmy, że SOX11 moduluje ekspresję COL3A1. Odkrycia te wspierają przyszłe prace z wykorzystaniem tego systemu do identyfikacji innych genów, które są różnie wyrażane w całym genomie i innych SNP, które są zaangażowane w ryzyko złamań.

Warto przeczytać!  Czy istnieje działający gen?

Zapisać się do

„Podejście to może być bardzo cenne w rozwiązywaniu złożoności genetycznych podstaw ryzyka złamań”.

Naukowcy stwierdzili, że wykazano, że na ryzyko takich złamań mają wpływ zarówno czynniki środowiskowe, jak i genetyczne, ale do tej pory nie zidentyfikowano żadnych konkretnych mechanizmów genetycznych leżących u podstaw złamań. Celem badania było wykorzystanie oceny ryzyka poligenicznego obejmującego cały genom w celu ustanowienia systemu komórek in vitro do badania regulacji genów kości u koni o wysokim i niskim genetycznym ryzyku złamań. Analiza ekspresji genów kandydujących ujawniła zróżnicowaną ekspresję genów COL3A1 i STAT1 w osteoblastach pochodzących od koni wysokiego i niskiego ryzyka.

„Sekwencjonowanie całego genomu koni ze złamaniami i koni kontrolnych ujawniło polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) powyżej COL3A1, co zostało potwierdzone w większej kohorcie jako istotnie związane ze złamaniami” – czytamy w streszczeniu badania.

Autorami badania są Esther Palomino Lago i Amy C. Ross z Royal Veterinary College, Arabella Baird i Rhona McPhail z Animal Health Trust, Sarah Blott z University of Nottingham, Sian Durward-Arkhurst z University of Minnesota oraz autorka korespondencyjna Debbie Guest .

Warto przeczytać!  Nowo zidentyfikowane biomarkery mogą wykryć wczesne pogorszenie funkcji poznawczych za pomocą badania krwi

Przed formalną publikacją w czasopiśmie naukowym artykuły naukowe i medyczne są tradycyjnie certyfikowane przez „peer review”. W tym procesie redaktorzy czasopisma korzystają z porad różnych ekspertów – zwanych „recenzentami” – którzy ocenili artykuł i mogą zidentyfikować słabości w jego założeniach, metodach i wnioskach. Zazwyczaj czasopismo publikuje artykuł tylko wtedy, gdy redaktorzy są przekonani, że autorzy odnieśli się do obaw recenzentów i że przedstawione dane potwierdzają wnioski wyciągnięte w artykule.

Ponieważ proces ten może być długotrwały, autorzy korzystają z usługi bioRxiv, aby udostępnić swoje manuskrypty jako „preprinty” przed certyfikacją przez recenzentów, umożliwiając innym naukowcom natychmiastowe zapoznanie się, omówienie i skomentowanie wyników.


Źródło