Informacja prasowa

czwartek, 5 stycznia 2023 r

Badanie NIH pokazuje, że podejście oparte na genotypie odkrywa nowe powiązania z warunkami genetycznymi.

Naukowcy z National Institutes of Health opublikowali ocenę 13 badań, w których przyjęto podejście do opieki nad pacjentem na pierwszym miejscu pod względem genotypu. Podejście to kontrastuje z typowym podejściem fenotypowym do badań klinicznych, które zaczyna się od wyników klinicznych. Podejście do opieki nad pacjentem oparte na genotypie obejmuje selekcję pacjentów z określonymi wariantami genomowymi, a następnie badanie ich cech i objawów; odkrycie to ujawniło nowe zależności między genami a stanami klinicznymi, poszerzyło cechy i objawy związane ze znanymi zaburzeniami oraz dostarczyło wglądu w nowo opisane zaburzenia. Badanie zostało opublikowane w American Journal of Human Genetics.

„Wykazaliśmy, że badania genotypowe mogą działać, zwłaszcza w przypadku identyfikacji osób z rzadkimi zaburzeniami, które w przeciwnym razie mogłyby nie zostać objęte opieką kliniczną” — mówi dr Caralynn Wilczewski, doradca genetyczny w Narodowym Instytucie Badań nad Genomem Człowieka ( NHGRI) Reverse Phenotyping Core i pierwszy autor artykułu.

Zazwyczaj, aby leczyć choroby genetyczne, naukowcy najpierw identyfikują pacjentów, u których występują objawy, a następnie szukają wariantów w genomach pacjentów, które mogłyby wyjaśnić te odkrycia. Może to jednak prowadzić do stronniczości, ponieważ naukowcy badają wyniki kliniczne w oparciu o ich zrozumienie zaburzenia. Podejście oparte na fenotypie ogranicza badaczy w zrozumieniu pełnego spektrum objawów zaburzeń i powiązanych wariantów genomowych.

„Genomika ma potencjał, by zmienić medycynę reaktywną w medycynę zapobiegawczą” – powiedział Leslie Biesecker, lekarz medycyny, wybitny badacz NIH, dyrektor Centrum Precyzyjnych Badań nad Zdrowiem NHGRI i główny autor artykułu. „Badanie, w jaki sposób podejście do badań oparte na genotypie może pomóc nam nauczyć się modelować medycynę predykcyjną i precyzyjną w przyszłości”.

Badanie dokumentuje trzy rodzaje odkryć z podejścia opartego na genotypie.

Po pierwsze, naukowcy odkryli, że takie podejście pomogło odkryć nowe zależności między wariantami genomowymi a określonymi cechami klinicznymi. Na przykład jedno badanie NIH wykazało, że posiadanie więcej niż dwóch kopii TPSAB1 gen był związany z objawami związanymi z przewodem pokarmowym, tkanką łączną i układem nerwowym.

Po drugie, podejście to pomogło naukowcom znaleźć nowe objawy związane z zaburzeniem, które klinicyści wcześniej przeoczyli, ponieważ pacjent nie miał typowych objawów. Naukowcy z NHGRI zidentyfikowali osobę z wariantem genomowym związanym ze znanym zaburzeniem metabolicznym. Dalsze testy wykazały, że osoba miała wysoki poziom niektórych substancji chemicznych w organizmie związanych z zaburzeniem, pomimo niewielkich objawów.

Po trzecie, podejście to umożliwiło naukowcom określenie funkcji określonych wariantów genomowych, co może pomóc klinicystom w zrozumieniu nowo opisanych zaburzeń. Na przykład w jednym badaniu naukowcy z NHGRI i ich współpracownicy odkryli, że wariant genomowy był powiązany z dysfunkcją immunologiczną na poziomie molekularnym w komórkach krwi.

W 13 badaniach, w których wdrożono podejście oparte na genotypie, wykorzystano dane genomowe z rdzenia odwrotnego fenotypowania NHGRI w Centrum Precyzyjnych Badań nad Zdrowiem. Rdzeń agreguje dane genomowe z programów takich jak ClinSeq^(R) oraz protokół scentralizowanego sekwencjonowania Narodowego Instytutu Alergii i Chorób Zakaźnych (NIAID), który razem umożliwił przeprowadzenie analiz ponad 16 000 uczestników badań, którzy przeszli sekwencjonowanie genomu lub egzomu.

Dane z sekwencjonowania egzomu i genomu od uczestników, którzy zgodzili się na szerokie udostępnianie danych genomicznych i ponowne skontaktowanie się w celu przyszłych badań naukowych, są obecnie dostępne dla badaczy stacjonarnych NIH za pośrednictwem przeglądarki danych genomowych odwrotnego fenotypowania w celu zidentyfikowania wariantów genomowych będących przedmiotem zainteresowania dla ich własnych badań.

„Co ważne, zapewniamy ramy dla innych instytucji do tworzenia programów badawczych, które pozwalają na badania genotypowe. Dzięki większej liczbie programów stosujących to podejście możemy lepiej badać potencjał predykcyjny medycyny genomicznej” – powiedział dr Clesson Turner, dyrektor Reverse Phenotyping Core NHGRI i starszy autor artykułu.

Ramy obejmują szerokie udostępnianie danych genomicznych z możliwością ponownego kontaktu z uczestnikami wyraźnie określonymi podczas procesu świadomej zgody. Badacze NHGRI zalecają instytucjom, których celem jest utworzenie centrów zajmujących się badaniem genotypów, tworzenie planów strategicznych, zwłaszcza w celu decydowania, jakie wyniki badań genomowych zostaną zwrócone, co może obejmować usługi doradztwa genetycznego. Co ważne, zgodnie z badaniem naukowcy muszą aktywnie komunikować się z uczestnikami badania, aby budować świadome i oparte na zaufaniu długoterminowe relacje.

„W przyszłości, gdy coraz więcej badaczy przyjmie to podejście, mamy nadzieję zidentyfikować więcej osób, którym może pomóc dostępność ich sekwencji genomu, zwłaszcza że bardziej zróżnicowane populacje dołączają do badań nad sekwencjonowaniem genomu” – mówi dr Wilczewski.

Narodowy Instytut Badań nad Genomem Człowieka (NHGRI) jest jednym z 27 instytutów i ośrodków NIH, agencji Departamentu Zdrowia i Opieki Społecznej. NHGRI Division of Intramural Research opracowuje i wdraża technologię do zrozumienia, diagnozowania i leczenia chorób genomicznych i genetycznych. Dodatkowe informacje na temat NHGRI można znaleźć na stronie: www.genome.gov.

O Narodowych Instytutach Zdrowia (NIH):NIH, krajowa agencja badań medycznych, obejmuje 27 instytutów i ośrodków i jest częścią Departamentu Zdrowia i Opieki Społecznej Stanów Zjednoczonych. NIH jest główną agencją federalną prowadzącą i wspierającą podstawowe, kliniczne i translacyjne badania medyczne oraz bada przyczyny, leczenie i lekarstwa zarówno na powszechne, jak i rzadkie choroby. Więcej informacji o NIH i jego programach można znaleźć na stronie www.nih.gov.

NIH… Przekształcenie odkrycia w zdrowie^®

###