Naukowcy z Indiana University Melvin and Bren Simon Comprehensive Cancer Center ukończyli najszersze mapowanie zdrowych komórek piersi do tej pory. Odkrycia te oferują ważne narzędzie dla naukowców z IU i innych krajów, aby zrozumieć, jak rozwija się rak piersi i różnice w tkance piersi u różnych przodków genetycznych.

Opublikowano w tym miesiącu w Medycyna naturalnaNaukowcy opracowali kompleksowy atlas komórek tkanki piersi – zawierający szczegóły dotyczące organizacji genomu w każdym typie komórek i wpływu tej organizacji genomu na sposób wytwarzania RNA w każdym typie komórek, co steruje ich funkcją w różnych częściach piersi – wykorzystując zdrową tkankę piersi pochodzącą od kobiet o różnym pochodzeniu.

Rak piersi wykazuje zmienność w wynikach w zależności od pochodzenia genetycznego. Podczas gdy czynniki społeczno-ekonomiczne są z pewnością czynnikiem przyczyniającym się, uważamy, że biologia i pochodzenie również odgrywają rolę. To badanie pomoże nam zająć się tym biologicznym, przodkowym aspektem”.

Harikrishna Nakshatri, doktor, starszy autor badania

Nakshatri jest profesorem badań nad rakiem piersi im. Marian J. Morrison w IU School of Medicine oraz badaczem w Centrum Badań nad Rakiem Piersi Fundacji Very Bradley w IU Simon Comprehensive Cancer Center.

Laboratorium Nakshatri zsekwencjonowało 88 000 jąder komórkowych od 92 kobiet, które oddały zdrową tkankę piersi do Komen Tissue Bank w IU Simon Comprehensive Cancer Center. Dawcami byli ludzie pochodzenia afrykańskiego, europejskiego, rdzennych Amerykanów, Latynosów, Azjatów Wschodnich, Azjatów Południowo-Wschodnich i Aszkenazyjsko-Żydowsko-Europejskiego.

Mapowanie komórek obejmuje dane nie tylko o genach wyrażanych w różnych typach komórek, ale także o tym, jak geny są zorganizowane i jakie konkretne ekspresje genów są ograniczone do każdego typu komórek. Naukowcy wiedzą, że rak piersi najczęściej powstaje w określonych typach komórek, a miejsce jego powstania prowadzi do różnych typów raka i reakcji na leczenie. To badanie może poprawić zrozumienie rozwoju raka piersi i doprowadzić do zidentyfikowania nowych celów leczenia.

„Te badania miały na celu zrozumienie podstawowych elementów normalnej piersi – czyli ile różnych typów komórek występuje w normalnej piersi i czy podstawowe elementy komórek wykazują zmienność zależną od pochodzenia genetycznego” – powiedział Nakshatri. „Dopóki nie dowiemy się, z jakich typów komórek piersi pochodzi rak, nie będziemy w stanie ustalić, co dokładnie jest nie tak w przypadku raka piersi w porównaniu do normalnej piersi”.

Wcześniej dostępne zasoby badawcze wykorzystywały normalną tkankę z operacji raka piersi i próbki mammoplastyki redukującej. Komen Tissue Bank, jedyny na świecie bank zdrowej tkanki piersi, oferuje badaczom z IU wyjątkową okazję do przeprowadzenia tego badania.

„Używamy tkanek kobiet, które są klinicznie wolne od raka piersi; dlatego wierzymy, że dane, które stworzyliśmy, są bliskie doskonałości – naprawdę najbliższe, jakie można uzyskać” – powiedział Nakshatri. „Dane, które z tego wygenerowaliśmy, pozostaną na zawsze, ponieważ będą wykorzystywane przez wiele, wiele grup do przyszłych badań”.

Informacje z atlasu komórek uzyskane w ramach badania będą szeroko dostępne dla naukowców zajmujących się rakiem piersi za pośrednictwem baz danych udostępnionych przez Narodowe Instytuty Zdrowia, Human Cell Atlas i Chan Zuckerberg CELL by GENE Discover.

Badania te są ukoronowaniem prawie pięciu lat intensywnej pracy w laboratorium Nakshatri i analizy bioinformatycznej. Dodatkowi autorzy z IU School of Medicine i IU Simon Comprehensive Cancer Center to Poornima Bhat-Nakshatri, Hongyu Gao, Aditi S. Khatpe, Adedeji K. Adebayo, Patrick C. McGuire, Cihat Erdogan, Duojiao Chen, Guanglong Jiang, Rana German, Lydia Emmert, George Sandusky, Anna Maria Storniolo i Yunlong Liu.