Nauka i technika

PacBio’s Revio system sekwencjonowania długich odczytów, który pomaga Bioscientia rozwiązywać złożone przypadki genetyczne

  • 10 lipca, 2023
  • 4 min read
PacBio’s Revio system sekwencjonowania długich odczytów, który pomaga Bioscientia rozwiązywać złożone przypadki genetyczne


PacBio, wiodący twórca wysokiej jakości, bardzo dokładnych rozwiązań do sekwencjonowania, ogłosił dzisiaj, że Bioscientia używa swojego systemu sekwencjonowania z długim odczytem Revio, aby rozszerzyć swoje projekty badawcze w zakresie genomiki i sekwencjonować kilka tysięcy ludzkich genomów rocznie. Będąca częścią Sonic Healthcare Group, firma Bioscientia jest wiodącym światowym dostawcą usług badań laboratoryjnych do diagnostyki z siedzibą w Niemczech. Zwiększona dokładność, długość odczytu i spostrzeżenia dotyczące metylacji oferowane przez system Revio umożliwią firmie Bioscientia zbadanie pewnych zaburzeń monogenowych, takich jak głuchota, ślepota i opóźnienie rozwojowe, a także zbadanie przyczyn rzadkich chorób.

PacBio

Źródło obrazu: PacBio

„Bioscientia jest wiodącym na świecie dostawcą usług testowych i cieszymy się, że wybrali Revio do zbadania potencjalnego zastosowania klinicznego długiego odczytu sekwencjonowania” — powiedział Christian Henry, prezes i dyrektor generalny PacBio. „Revio pomoże firmie Bioscientia dostarczać więcej informacji rodzinom przy mniejszej liczbie testów, niższych całkowitych kosztach i krótszym czasie poświęconym na tworzenie map genomu. Badania te mają kluczowe znaczenie dla pogłębienia naszej wiedzy na temat roli genetyki w rzadkich chorobach i zaburzeniach rozwojowych. Współpraca z firmami takimi jak Bioscientia jest ważnym krokiem w realizacji misji PacBio polegającej na umożliwieniu obietnicy genomiki dla lepszego zdrowia ludzkiego”.

Warto przeczytać!  Baza danych CardioGen oferuje dane genotypowe dotyczące chorób sercowo-naczyniowych

Sekwencjonowanie całego genomu za pomocą systemu Revio umożliwia konsolidację wielu testów w jedno kompleksowe rozwiązanie, zastępując czasochłonny i kosztowny wieloetapowy proces weryfikacji rzadkich chorób i zaburzeń rozwojowych. Wcześniej wymagane były oddzielne eksperymenty, takie jak analiza chromosomów, optyczne mapowanie genomu i sekwencjonowanie egzomu z krótkim odczytem. Wykorzystując technologię Revio, badacze mogą teraz szybciej i wydajniej uzyskiwać ważne dane. Ten postęp pomaga obniżyć koszty, poprawić dostępność i dać rodzinom nadzieję na lepsze zrozumienie genetycznych podstaw niektórych rzadkich chorób, potencjalnie zmieniając krajobraz diagnostyki chorób rzadkich i oceny opóźnienia rozwojowego.

„Revio pozwoli nam odpowiedzieć na pytania, których wcześniej nie mogliśmy rozwiązać za pomocą samego sekwencjonowania egzomu – pomagając nam uporać się z wieloma nierozwiązanymi lub częściowo rozwiązanymi przypadkami” – skomentował profesor Hanno Bolz, MD, kierownik działu genetyki człowieka w firmie Bioscientia. „Zakup tych nowych systemów Revio znacznie rozszerzy możliwości genomiki firmy Bioscientia. Wyniki, które wcześniej wymagały kilku testów, można teraz uzyskać w jednym przebiegu dzięki Revio. Fazowanie haplotypów jest możliwe na pojedynczej próbce i nie wymaga już analizy segregacji rodzinnej. Odczyty HiFi obejmują powtarzalne regiony, geny z pseudogenowym tłem i pozwalają na analizę metylacji – dzięki czemu możemy wykryć defekty imprintingu. Wierzymy, że ta technologia przyniesie korzyści rodzinom, dając większą przejrzystość przyczyn chorób i ostatecznie skracając diagnostyczną odyseję, przed którą stają”.

Warto przeczytać!  Hog Futures Down – Cash Hogs Up – Dziwaczne

Bioscientia będzie również używać Revio do rozszerzonego testowania częściowo rozwiązanych próbek i scenariuszy chorób recesywnych. Są to sytuacje, w których istniejące technologie sekwencjonowania egzomu z krótkim odczytem firmy Bioscientia nie były w stanie zapewnić pełniejszych, ostatecznych wyjaśnień. Sekwencjonowanie HiFi zapewnia bardzo dokładną kompletną sekwencję genomu, co oznacza, że ​​zmiany strukturalne, a nawet „ukryte” mutacje genów w złożonych i trudnych do sekwencjonowania regionach są identyfikowane z większą pewnością.

Firma Bioscientia od ponad 50 lat jest pionierem innowacji w zakresie złożonych diagnoz i nie możemy się doczekać, aby pomóc jej w realizacji jej misji. Technologie sekwencjonowania PacBio należą do najdokładniejszych i najbardziej kompletnych dostępnych obecnie. Wierzymy, że w połączeniu z postępami w przepustowości i kosztach Revio umożliwi zespołowi Bioscientia dalsze przyspieszenie wiodących w terenie badań w wielu zastosowaniach w genomice”.

Jeff Eidel, dyrektor handlowy PacBio


Źródło