Borówka, pospolita Szczepionka gatunek o małych jagodach, słynie z pysznego smaku, zrównoważonej słodyczy i kwasowości oraz bogatej zawartości odżywczej. Jest bogaty w różne witaminy i przeciwutleniacze. Jednakże ograniczone zasoby genetyczne borówek uprawnych znacząco utrudniają ich rozwój i wykorzystanie. Dlatego też wykorzystanie zasobów genetycznych borówki leśnej do hodowli ma ogromne znaczenie dla zwiększenia odporności i jakości uprawianych odmian.

Vaccinium duclouxii, pochodząca z południowo-zachodniego regionu Chin, jest endemicznym gatunkiem dzikiej borówki o wysokiej wartości odżywczej, leczniczej i ozdobnej. Wykazuje również silną odporność i zdolność adaptacji do środowiska. Jednak brak genomu wysokiej jakości poważnie ogranicza jego zastosowanie i rozwój.

W październiku 2023 r. Badania ogrodnicze opublikował perspektywę zatytułowaną „Genom referencyjny dzikiej borówki (Vaccinium duclouxii) pozbawiony przerw między telomerami i telomerami zapewnia akumulację wysokorozpuszczalnego cukru i antocyjanów„.

W badaniu tym wykorzystano dane sekwencjonowania PacBio HiFi, ONT ultra-long i Hi-C w celu uzyskania połączenia telomer-telomer (T2T) de novo V. duclouxii genom. Rozmiar złożonego genomu wynosił 573,67 Mb, co umożliwiło pomyślne wychwytywanie wszystkich 12 chromosomów bez przerw i całkowitą adnotację obejmującą 41 953 genów. Powtarzające się sekwencje stanowiły 54,84%, co dało najbardziej kompletny i wysokiej jakości genom rodzaju Vaccinium. Łącząc analizy transkryptomiczne i metabolomiczne, badanie ujawniło mechanizmy molekularne leżące u podstaw akumulacji cukru i kwasu oraz biosyntezy antocyjanów podczas dojrzewania owoców. V. duclouxii. Badania te stanowią podstawę do zrozumienia ewolucji Szczepionka rodzaju i dostarcza cennych spostrzeżeń na potrzeby przyszłego doskonalenia genetycznego i wysiłków hodowlanych borówek amerykańskich.

###

Bibliografia

Autorski

Zeng T, He ZJ, He JF, Lv W, Huang SX, Li JW, Zhu LY, Wan S, Zhou WF, Yang ZS, Zhang YT, Luo C, He JW, Wang CY, Wang LS

Przynależności

1 Szkoła Nauk Przyrodniczych, Uniwersytet Normalny w Guizhou, Guiyang 550000, Chiny;

2 Instytut Alpejskich Roślin Gospodarczych, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Lijiang 674199, Yunnan, Chiny;

3 Szkoła Zaawansowanych Nauk Rolniczych, Uniwersytet Pekiński, 100871 Pekin, Chiny;

4 Krajowe kluczowe laboratorium ds. innowacji i wykorzystania plazmy zarodkowej w uprawach ogrodniczych, Wyższa Szkoła Ogrodnictwa i Nauk Leśnych, Uniwersytet Rolniczy Huazhong, Wuhan 430070, Chiny;

5 Wuhan Benagen Technology Co., Ltd, Wuhan 430070, Chiny;

6 Kluczowe Laboratorium Zasobów Roślinnych, Instytut Botaniki, Chińska Akademia Nauk, Pekin 100093, Chiny.

O Caiyun Wang

Caiyun Wang: profesor w Wyższej Szkole Ogrodnictwa i Nauk Leśnych Uniwersytetu Rolniczego w Huazhong