Zarządzanie ocenami genetycznymi przy ograniczonych informacjach

OPUBLIKOWANO DNIA 5 czerwca 2024 r

GREENWICH, NY — Witamy ponownie w kolumnie Plany wołowiny! Po krótkiej przerwie z radością wracamy do dostarczania Państwu cennych spostrzeżeń i praktycznych wskazówek dotyczących produkcji wołowiny. W tym wydaniu poruszamy palący problem, przed którym staje wielu producentów: w jaki sposób uwzględnić buhaje zakupione z ograniczoną informacją genetyczną w ocenie genetycznej związku rasy. Dołącz do Chipa Kempa, dyrektora ASA i IGS Commercial and Industry Operations, badając opcje i implikacje dla producentów poruszających się w tym złożonym krajobrazie.

Tło

Producent niedawno nabył grupę rocznych buhajów do wykorzystania jako buhaje sprzątające w ramach ustalonego programu sztucznej inseminacji w swoim stadzie. Byki zakupiono od firmy produkującej nasienie, która poza swoją podstawową działalnością polegającą na obsłudze przemysłu sztucznej inteligencji, generuje rocznie ograniczoną liczbę chodzących byków. Ta firma zajmująca się nasieniem stara się odpowiedzialnie wykorzystywać heterozję, komplementarność ras i dane. Jednakże wysiłki tej firmy w zakresie selekcji genetycznej prowadzone są w ramach sprywatyzowanego programu, który nie umożliwia nabywcy żadnych szczegółowych informacji o rodowodzie ani rasie, ani wiedzy genetycznej byka na poziomie EPD. Kiedy producent postanowił włączyć informacje o buhajach do oceny genetycznej swojego stowarzyszenia hodowców, stanął przed wyzwaniem.

Pytanie: jakie możliwości ma producent w związku z włączeniem nieznanych buhajów do oceny genetycznej stowarzyszenia hodowców?

Odpowiedź

Tak naprawdę ten producent jest w trudnej sytuacji.

Bez niezbędnego rodowodu i świadomości rasy trudno będzie temu zwierzęciu odpowiedzialnie włączyć się do większości poważnych ocen genetycznych. W wiarygodnej ocenie genetycznej nie ma dróg na skróty. Za każdym razem, gdy pomijamy określone typy informacji, zmniejszamy dokładność wszelkich przewidywań EPD. Z drugiej strony większy wgląd i wiedza oznaczają większą dokładność. Żeby było jasne, nie oznacza to, że EPD stanie się mniej lub bardziej korzystna, ale raczej, że będziemy mogli dokładniej i z większą dokładnością przewidzieć wyniki leczenia cieląt. Dokładność mieści się w zakresie od 0 do 1,0. Praktycznie nigdy nie osiągamy wartości 1,0, ale im bliżej 1, tym lepiej. Najbardziej idealnym wynikiem jest korzystna EPD o wysokiej dokładności.

Jakie informacje są pożądane? 1) Rodowód i skład rasy są niezbędne do dokładnego przewidywania. Umożliwiają powiązanie z innymi spokrewnionymi zwierzętami, co z kolei pozwala na wyciągnięcie większej wartości predykcyjnej z tych powiązań. 2) Fenotypy (rzeczywiste miary rzeczywistych cech) zapewniają poważny wgląd w potencjał genetyczny zwierzęcia. W dużym stopniu stanowią one podstawę wiarygodnej oceny genetycznej. 3) Genomika, jak omówiono w poprzednich artykułach, nie jest magią. Same w sobie zapewniają wartość predykcyjną o niskiej dokładności. Jednak w połączeniu z rodowodami i fenotypami tworzą trójnożną podstawę współczesnych, poważnych wysiłków genetycznych.

W sytuacji tego producenta nie mamy żadnej z tych informacji, które moglibyśmy umieścić w ocenie genetycznej. Wiele stowarzyszeń hodowców po prostu nie dopuści tych byków do oceny. Okres. W innych sytuacjach stowarzyszenie może zezwolić producentowi na przyjęcie pewnych podstawowych założeń co do buhajów, które spełnią przynajmniej próg wpisu do rejestru. Należy jednak pamiętać, że dokładność prognozy wyniesie zasadniczo 0. Oznacza to, że nawet jeśli byki są zwierzętami o wyższej genetyce (co prawdopodobnie ma miejsce w tej sytuacji), ich potomstwo będzie potrzebowało znacznej ilości danych, aby osiągnąć punkt samych lepszych EPD, ponieważ byki są „czarną skrzynką” informacji, która działa jak kotwica w EPD potomstwa.

Chcę, żeby coś było jasne. Jest prawie pewne, że firma produkująca nasienie w sposób odpowiedzialny wykorzystała wszystkie te dane lub ich kombinację, aby poznać sprzedane buhaje. Niekoniecznie pojawia się pytanie o wartość genetyczną reproduktorów. W rzeczywistości buhaje otrzymały sprywatyzowany indeks selekcji genomowej. Chociaż baza danych, z której wyprowadzono ten indeks, jest prawdopodobnie wyraźnie mniejsza niż bazy danych stowarzyszeń dużych ras lub z pewnością największe opcje oceny genetycznej wielu ras, nadal prawdopodobnie opiera się na lepszej genetyce. Problem polega na tym, że nie ma żadnych potrzebnych informacji, z którymi można byłoby się zapoznać, gdy właściciele tych byków chcą zaimportować je do baz danych stowarzyszeń. Pustka informacji czyni je całkowicie niepoznawalnymi i całkowicie nieprzewidywalne dla użytkownika i wszelkich potencjalnych ocen, z którymi współpracują.

Jaka jest odpowiedź?

Krótka odpowiedź dla tego producenta prawdopodobnie nie jest tym, co chce usłyszeć. Są zdani na łaskę swojego szczególnego związku rasy. Stowarzyszenie to ma pełne prawo do wykluczenia zwierząt z oceny genetycznej lub może zezwolić na wpis, jak to opisuję powyżej, wiedząc cały czas, że wartość predykcyjna jest wyjątkowo niska.

Odpowiedź na dłużej

Jeśli jesteś zainteresowany posiadaniem najwyższej świadomości genetycznej w hodowli wołowiny, niezależnie od tego, czy zajmujesz się produkcją materiału siewnego, czy komercyjnym, musisz długo i ciężko myśleć, czy ryzyko nieznanego jest warte nagrody w postaci zakupu byka. Może to jest. Może tak nie jest. To decyzja biznesowa, którą każdy producent podejmie sam.

Odpowiedzi na Twoje najważniejsze pytania dotyczące genetyki bydła

Uwielbiamy otrzymywać takie pytania dla Schematy wołowiny kolumna. Pamiętaj, aby zadawać pytania poprzez ten formularz i co tydzień sprawdzaj interesujące informacje, które pozwolą Ci mieć kontrolę nad działalnością związaną z wołowiną. Pamiętaj, że to Ty sterujesz swoją operacją i upewnij się, że posiadasz wszystkie informacje potrzebne do obrania ścieżki prowadzącej do największego sukcesu.