Zgodnie z nowymi odkryciami zidentyfikowano odrębną ekspresję genów w raku płaskonabłonkowym skóry T2a (cSCC) związanym ze złymi wynikami.

Naukowcy odkryli, że 12 genów uległo znacznej regulacji w górę w nowotworach ze złymi wynikami, a cztery nowe geny zostały obniżone u pacjentów ze złymi wynikami. Niektóre z tych samych genów są regulowane w górę lub w dół w innych typach raka.

„Mamy nadzieję, że nasze odkrycia będą miały implikacje w praktyce klinicznej, ponieważ wyjaśnienie tych prognostycznych biomarkerów może zidentyfikować nowotwory o niskim stopniu zaawansowania i pacjentów, którzy mogą odnieść korzyści z dokładniejszego nadzoru, zmodyfikowanej pracy i bardziej agresywnego leczenia” – powiedział główny autor, Jaclyn R. Himeles, MD, dermatolog rezydent w New York University Grossman School of Medicine w Nowym Jorku. „Zrozumienie profilowania ekspresji genów może pomóc w identyfikacji nowych celów terapeutycznych”.

„Podczas gdy trwają eksperymenty walidacyjne, identyfikacja biomarkerów o złym rokowaniu może potencjalnie przyczynić się do stratyfikacji ryzyka guzów T2a, umożliwiając dokładniejszy nadzór nad guzami wysokiego ryzyka” – dodała.

Odkrycia zostały zaprezentowane na dorocznym spotkaniu American College of Mohs Surgery w 2023 roku.

SCC należą do najczęściej występujących nowotworów u ludzi, a cSCC jest drugim najczęściej występującym nowotworem w Stanach Zjednoczonych. Chociaż większość pacjentów ma dobre wyniki, podgrupa będzie miała słabe wyniki, wyjaśnił Himeles.

Nowotwory są klasyfikowane na podstawie liczby czynników wysokiego ryzyka i chociaż większość złych wyników występuje w przypadku guzów o wysokim stopniu zaawansowania, jedna czwarta występuje w przypadku guzów o niskim stopniu zaawansowania. U około 26% pacjentów rozwijają się przerzuty do węzłów chłonnych, a rozpoznanie różnic w ekspresji genomu między guzami T2a z dobrymi i złymi rokowaniami może pomóc w poprawie oceny ryzyka i rokowania.

„Jednak nasze obecne rozumienie immunofenotypowych czynników prognostycznych pozostaje ograniczone” – powiedział Himeles. „Dlatego staraliśmy się zdefiniować zróżnicowaną ekspresję genów wśród T2a cSCC ze słabymi wynikami w porównaniu z tymi z dobrymi wynikami i normalną skórą”.

Szczegóły badania

Himeles i współpracownicy przeprowadzili badanie translacyjne w jednym ośrodku i wykorzystali technologię NanoString do określenia zróżnicowanej ekspresji genów w różnych grupach pacjentów z cSCC. Wykorzystali również retrospektywny przegląd wykresów, aby powiązać wzorce genów o zróżnicowanej ekspresji z wynikami klinicznymi.

W NanoString sondy mRNA specyficzne dla sekwencji są używane do bezpośredniego wykrywania ekspresji genów i zwracania zliczeń każdej cząsteczki docelowej. Ekspresję RNA 774 genów oceniono za pomocą tej technologii, stosując utrwalone w formalinie, zatopione w parafinie guzy pierwotne, które obejmowały pierwotne guzy T2a o słabym wyniku i guzy T2a o dobrym wyniku oraz normalną skórę. Badacze zdefiniowali złe wyniki jako nawrót miejscowy, przerzuty w tranzycie, przerzuty do węzłów chłonnych, przerzuty odległe lub zgon związany z chorobą.

Oceniono łącznie 27 guzów T2a u 27 pacjentów wraz z pięcioma normalnymi próbkami skóry. Średni wiek pacjentów w kohorcie wynosił 76 lat, a większość guzów była zlokalizowana na głowie i szyi. Średni okres obserwacji wynosił 43 miesiące.

W tej grupie zidentyfikowano 14 guzów T2a ze złymi wynikami, z których większość zlokalizowana była na głowie i szyi; 71% pacjentów miało immunosupresję. Wszyscy pacjenci mieli średnicę guza > 2 cm, a średni okres obserwacji wynosił 44 miesiące.

W podgrupie ze złymi wynikami dziewięciu pacjentów miało miejscowe nawroty, jeden miał przerzuty do węzłów chłonnych, jeden miał przerzuty w tranzycie, a trzech miało odległe przerzuty. Naukowcy zidentyfikowali 12 genów, które uległy znacznej regulacji w górę (P < 0,05) wśród guzów ze złym rokowaniem: STC1, CCL20, CXCL6, KLRB1, TRAT1, TNFAIP6, WNT11, PALMA, IL7R, VCAM1, TNFAIP3I DAB2. Ponadto cztery nowe geny zostały obniżone u pacjentów ze złymi wynikami: LILRA3, SLC11A1, IL17REI DDB2.

Po wykluczeniu pacjentów po przeszczepach z analizy stwierdzono, że 11 genów jest regulowanych w górę w guzach o słabym wyniku (STC1, CCL20, CXCL6, TNFAIP6, LGR5, IL7R, KLRB1, ITGA2, TNFAIP3, CD45RBI RIPK2), a 14 genów zostało obniżonych (HRAS, LILRA3, TGFB1, MAKRO, APLNR, HLA-F, APOL6, BNIP3, DDB2, PIK3R2, CHUK, GLS, GALNT2I SGK1).

Naukowcy porównali również guzy o dobrym i złym wyniku z prawidłową tkanką i zidentyfikowali 61 regulowanych w górę genów w guzach o słabym wyniku i 33 regulowanych w górę genów w guzach o dobrym wyniku. Odkryli również, że 221 genów zostało obniżonych w nowotworach o słabym wyniku, a dziewięć w guzach o dobrym wyniku.

„Sugeruje to, że guzy z dobrymi wynikami są bliżej spokrewnione z normalną skórą, w przeciwieństwie do guzów o słabych wynikach” – wyjaśnił Himeles. „Zrozumienie profilowania ekspresji genów może pomóc w identyfikacji nowych celów terapeutycznych”.

Zachęcające, ale wstępne

Komentując streszczenie, Anthony J. Olszanski, RPh, MD, profesor nadzwyczajny w Departamencie Hematologii/Onkologii Fox Chase Cancer Center w Filadelfii, Pensylwania, zauważył, że choć SCC skóry jest jednym z najczęstszych nowotworów i pacjentów z cechami wysokiego ryzyka częściej rozwijają się nawroty, w tym przerzuty do węzłów chłonnych i zgon z powodu choroby, brakuje optymalnej stratyfikacji pacjentów.

„Profilowanie ekspresji genów może być w stanie pomóc w określeniu, którzy pacjenci są bardziej narażeni na złe wyniki” – powiedział. „Wyniki przedstawione przez dr Himelesa zachęcają do wstępnej identyfikacji wzorców ekspresji genów, które mogą pomóc w prognozowaniu”.

„Ostatecznie zastosowanie tej technologii wymaga walidacji, a ostatecznie bezpośredniego dowodu, że wczesna identyfikacja pacjentów z grupy ryzyka zapewnia lepsze wyniki kliniczne” – ostrzegł. „Należy zauważyć, że bez dowodów na bezpośrednie korzyści dla pacjentów, masowe stosowanie testów genomowych może wiązać się ze zwiększonym niepokojem pacjentów i zwiększonym obciążeniem kosztowym”.

Nie zgłoszono żadnego zewnętrznego finansowania badania. Himeles nie miał żadnych ujawnień. Olszański ujawnił wsparcie finansowe ze strony Merck i BMS dla rad doradczych. Merck produkuje pembrolizumab, a BMS niwolumab, a leki te odgrywają pewną rolę w tych chorobach.

Doroczne spotkanie American College of Mohs Surgery (ACMS) 2023. Przedstawiony 5 maja.

Roxanne Nelson jest zarejestrowaną pielęgniarką i wielokrotnie nagradzaną pisarką medyczną, która pisze dla wielu głównych serwisów informacyjnych i regularnie współpracuje z Medscape.

Aby uzyskać więcej informacji, śledź Medscape na Facebooku, ŚwiergotInstagrama i YouTube