Nauka i technika

Qiagen N: Digital Insights uruchamia ultraszybką analizę NGS, która jest w stanie przetworzyć cały genom w 25 minut za 1 USD kosztów przetwarzania w chmurze

  • 24 stycznia, 2023
  • 5 min read
Qiagen N: Digital Insights uruchamia ultraszybką analizę NGS, która jest w stanie przetworzyć cały genom w 25 minut za 1 USD kosztów przetwarzania w chmurze


  • Nowa innowacja mająca na celu zmianę szybkości i kosztów sekwencjonowania całego egzomu (WES) i sekwencjonowania całego genomu (WGS)
  • Usuwa kluczowe bariery związane z kosztami i szybkością wdrażania badań przesiewowych WES i WGS
  • Zawarte w wiodącej na rynku platformie analitycznej CLC do użytku w chmurze, na serwerze lub na komputerze stacjonarnym

Redwood City, Kalifornia i Hilden, Niemcy, 23 stycznia 2023 r — QIAGEN Digital Insights (QDI), dział bioinformatyki firmy QIAGEN, ogłosił dzisiaj udoskonalone oprogramowanie QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium, które usuwa wąskie gardło w analizie danych sekwencjonowania nowej generacji (NGS), dodając przełomową szybkość analizy do analizowania i interpretowania sekwencjonowanie całego genomu (WGS), sekwencjonowanie całego egzomu (WES) i dane sekwencjonowania dużego panelu.

Aktualizacja QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium obejmuje technologię LightSpeed, akcelerator programowy, który z niespotykaną szybkością konwertuje surowe dane sekwencjonowania w plikach FASTQ z dowolnej platformy sekwencjonowania z krótkim odczytem sparowanych końcówek na możliwe do interpretacji listy wariantów genetycznych w formacie VCF. Może analizować cały ludzki genom przy 34-krotnym pokryciu na zwykłym komputerze w zaledwie 25 minut i 50-krotnym całym egzomie w 90 sekund w standardowych środowiskach chmurowych. Dzięki technologii QIAGEN CLC LightSpeed ​​laboratoria mogą przeprowadzać analizy WGS za około 1 USD za genom i WES za mniej niż kilka centów za egzom, korzystając z infrastruktury chmury. Alternatywnie laboratoria mogą wydajnie wykorzystywać technologię QIAGEN CLC LightSpeed ​​na istniejącym lokalnym sprzęcie z podobną wydajnością.

Warto przeczytać!  Czy Twój koń jest wyjątkowo straszny? Nowe badanie University of Florida sugeruje, że może to być w genach

„QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium jest znacznie szybszy, dokładniejszy, bardziej ekologiczny i tańszy niż poprzednie rozwiązania do analizy danych i wizualizacji” — powiedział dr Jonathan Sheldon, starszy wiceprezes firmy QIAGEN Digital Insights. „Dzięki przełomowej technologii LightSpeed ​​analiza WGS jest niezwykle szybka, przewyższa większość innych przepływów pracy FASTQ do VCF pod względem dokładności, zużywa mniej energii i nie wymaga inwestycji w nowy sprzęt ani licencje na oprogramowanie poza CLC”.

Inwestycja QDI w technologię LightSpeed ​​idealnie pasuje do obszarów NGS, takich jak badania przesiewowe noworodków pod kątem chorób dziedzicznych lub duże badania genomiki populacyjnej, w których szybkość i koszt są priorytetami. To ulepszenie w oprogramowaniu do analizy wtórnej CLC Genomics dowodzi stałego przywództwa firmy QIAGEN i zaangażowania w ukierunkowane obszary wzrostu, w tym WGS i WES.

„LightSpeed ​​pozwoli firmie QDI utrzymać pozycję lidera w dziedzinie analizy danych, podczas gdy rynek odchodzi od analizy kilkuset wybranych genów do kompleksowych testów genetycznych” — kontynuuje Jonathan Sheldon. „Jego efektywność kosztowa i czasowa daje wysokowydajnym laboratoriom sekwencjonowania NGS szansę na szerokie zastosowanie tej technologii dla klientów klinicznych i badawczych. Im szybciej zostaną wykryte niechciane mutacje, tym szybciej można będzie zidentyfikować i leczyć związane z nimi choroby”.

Warto przeczytać!  Trendy w branży biotechnologicznej i marketingu na rok 2023

Modele licencjonowania QDI umożliwiają laboratoriom równoległą analizę próbek WGS i WES. Ich QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium to ekonomiczne, skalowalne rozwiązanie, które może analizować dane NGS z dowolnej platformy sekwencjonowania i działa lokalnie, na serwerze lub w chmurze.

Dowiedz się więcej o technologii LightSpeed ​​dostępnej teraz w QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium: https://digitalinsights.qiagen.com/news/blog/discovery/analyze-whole-genome-sequencing-samples-at-the-speed-of-light /

Informacje o cyfrowych wglądach firmy QIAGEN

QIAGEN Digital Insights, dział bioinformatyki firmy QIAGEN, jest wiodącym dostawcą wiedzy genomicznej i klinicznej, narzędzi do analizy i interpretacji oraz usług dla naukowców i klinicystów. Mamy ponad 25 lat doświadczenia w branży, 90 000 użytkowników na całym świecie, ponad 100 000 cytowań w artykułach naukowych, ponad 3 miliony profilowanych przypadków pacjentów i ponad 40 miliardów punktów danych naukowych. Odkryj nasze portfolio opracowanych przez ekspertów rozwiązań z zakresu wiedzy genomicznej i klinicznej, a także oprogramowania i usług bioinformatycznych do wydajnego zarządzania danymi, udostępniania ich i praktycznych spostrzeżeń.

O firmie QIAGEN

QIAGEN NV, holenderska spółka holdingowa, jest wiodącym globalnym dostawcą rozwiązań Sample to Insight, które umożliwiają klientom uzyskanie cennych informacji molekularnych z próbek zawierających elementy budulcowe życia. Nasze technologie pobierania próbek pozwalają izolować i przetwarzać DNA, RNA i białka z krwi, tkanek i innych materiałów. Technologie testowe sprawiają, że te biomolekuły są widoczne i gotowe do analizy. Oprogramowanie bioinformatyczne i bazy wiedzy interpretują dane w celu zgłaszania odpowiednich, przydatnych spostrzeżeń. Rozwiązania automatyzacyjne łączą te elementy w bezproblemowe i ekonomiczne przepływy pracy. QIAGEN dostarcza rozwiązania dla ponad 500 000 klientów na całym świecie w zakresie diagnostyki molekularnej (opieka zdrowotna), badań stosowanych (głównie kryminalistyka), farmaceutycznego (firmy farmaceutyczne i biotechnologiczne) oraz środowisk akademickich (badania w dziedzinie nauk przyrodniczych). Na dzień 30 czerwca 2022 r. firma QIAGEN zatrudniała ponad 6100 osób w ponad 35 lokalizacjach na całym świecie. Więcej informacji można znaleźć pod adresem

Warto przeczytać!  Nie przegap dzisiejszego wieczoru Saturna i Wenus razem na nocnym niebie


Źródło