Qiagen N: Digital Insights uruchamia ultraszybką analizę NGS, która jest w stanie przetworzyć cały genom w 25 minut za 1 USD kosztów przetwarzania w chmurze
- Nowa innowacja mająca na celu zmianę szybkości i kosztów sekwencjonowania całego egzomu (WES) i sekwencjonowania całego genomu (WGS)
- Usuwa kluczowe bariery związane z kosztami i szybkością wdrażania badań przesiewowych WES i WGS
- Zawarte w wiodącej na rynku platformie analitycznej CLC do użytku w chmurze, na serwerze lub na komputerze stacjonarnym
Redwood City, Kalifornia i Hilden, Niemcy, 23 stycznia 2023 r — QIAGEN Digital Insights (QDI), dział bioinformatyki firmy QIAGEN, ogłosił dzisiaj udoskonalone oprogramowanie QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium, które usuwa wąskie gardło w analizie danych sekwencjonowania nowej generacji (NGS), dodając przełomową szybkość analizy do analizowania i interpretowania sekwencjonowanie całego genomu (WGS), sekwencjonowanie całego egzomu (WES) i dane sekwencjonowania dużego panelu.
Aktualizacja QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium obejmuje technologię LightSpeed, akcelerator programowy, który z niespotykaną szybkością konwertuje surowe dane sekwencjonowania w plikach FASTQ z dowolnej platformy sekwencjonowania z krótkim odczytem sparowanych końcówek na możliwe do interpretacji listy wariantów genetycznych w formacie VCF. Może analizować cały ludzki genom przy 34-krotnym pokryciu na zwykłym komputerze w zaledwie 25 minut i 50-krotnym całym egzomie w 90 sekund w standardowych środowiskach chmurowych. Dzięki technologii QIAGEN CLC LightSpeed laboratoria mogą przeprowadzać analizy WGS za około 1 USD za genom i WES za mniej niż kilka centów za egzom, korzystając z infrastruktury chmury. Alternatywnie laboratoria mogą wydajnie wykorzystywać technologię QIAGEN CLC LightSpeed na istniejącym lokalnym sprzęcie z podobną wydajnością.
„QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium jest znacznie szybszy, dokładniejszy, bardziej ekologiczny i tańszy niż poprzednie rozwiązania do analizy danych i wizualizacji” — powiedział dr Jonathan Sheldon, starszy wiceprezes firmy QIAGEN Digital Insights. „Dzięki przełomowej technologii LightSpeed analiza WGS jest niezwykle szybka, przewyższa większość innych przepływów pracy FASTQ do VCF pod względem dokładności, zużywa mniej energii i nie wymaga inwestycji w nowy sprzęt ani licencje na oprogramowanie poza CLC”.
Inwestycja QDI w technologię LightSpeed idealnie pasuje do obszarów NGS, takich jak badania przesiewowe noworodków pod kątem chorób dziedzicznych lub duże badania genomiki populacyjnej, w których szybkość i koszt są priorytetami. To ulepszenie w oprogramowaniu do analizy wtórnej CLC Genomics dowodzi stałego przywództwa firmy QIAGEN i zaangażowania w ukierunkowane obszary wzrostu, w tym WGS i WES.
„LightSpeed pozwoli firmie QDI utrzymać pozycję lidera w dziedzinie analizy danych, podczas gdy rynek odchodzi od analizy kilkuset wybranych genów do kompleksowych testów genetycznych” — kontynuuje Jonathan Sheldon. „Jego efektywność kosztowa i czasowa daje wysokowydajnym laboratoriom sekwencjonowania NGS szansę na szerokie zastosowanie tej technologii dla klientów klinicznych i badawczych. Im szybciej zostaną wykryte niechciane mutacje, tym szybciej można będzie zidentyfikować i leczyć związane z nimi choroby”.
Modele licencjonowania QDI umożliwiają laboratoriom równoległą analizę próbek WGS i WES. Ich QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium to ekonomiczne, skalowalne rozwiązanie, które może analizować dane NGS z dowolnej platformy sekwencjonowania i działa lokalnie, na serwerze lub w chmurze.
Dowiedz się więcej o technologii LightSpeed dostępnej teraz w QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium: https://digitalinsights.qiagen.com/news/blog/discovery/analyze-whole-genome-sequencing-samples-at-the-speed-of-light /
Informacje o cyfrowych wglądach firmy QIAGEN
QIAGEN Digital Insights, dział bioinformatyki firmy QIAGEN, jest wiodącym dostawcą wiedzy genomicznej i klinicznej, narzędzi do analizy i interpretacji oraz usług dla naukowców i klinicystów. Mamy ponad 25 lat doświadczenia w branży, 90 000 użytkowników na całym świecie, ponad 100 000 cytowań w artykułach naukowych, ponad 3 miliony profilowanych przypadków pacjentów i ponad 40 miliardów punktów danych naukowych. Odkryj nasze portfolio opracowanych przez ekspertów rozwiązań z zakresu wiedzy genomicznej i klinicznej, a także oprogramowania i usług bioinformatycznych do wydajnego zarządzania danymi, udostępniania ich i praktycznych spostrzeżeń.
O firmie QIAGEN
QIAGEN NV, holenderska spółka holdingowa, jest wiodącym globalnym dostawcą rozwiązań Sample to Insight, które umożliwiają klientom uzyskanie cennych informacji molekularnych z próbek zawierających elementy budulcowe życia. Nasze technologie pobierania próbek pozwalają izolować i przetwarzać DNA, RNA i białka z krwi, tkanek i innych materiałów. Technologie testowe sprawiają, że te biomolekuły są widoczne i gotowe do analizy. Oprogramowanie bioinformatyczne i bazy wiedzy interpretują dane w celu zgłaszania odpowiednich, przydatnych spostrzeżeń. Rozwiązania automatyzacyjne łączą te elementy w bezproblemowe i ekonomiczne przepływy pracy. QIAGEN dostarcza rozwiązania dla ponad 500 000 klientów na całym świecie w zakresie diagnostyki molekularnej (opieka zdrowotna), badań stosowanych (głównie kryminalistyka), farmaceutycznego (firmy farmaceutyczne i biotechnologiczne) oraz środowisk akademickich (badania w dziedzinie nauk przyrodniczych). Na dzień 30 czerwca 2022 r. firma QIAGEN zatrudniała ponad 6100 osób w ponad 35 lokalizacjach na całym świecie. Więcej informacji można znaleźć pod adresem