Technologia naukowa

21 lutego 2023 r

Rutgers Office for Research podpisało z SoftGenetics, LLC wyłączną licencję na komercjalizację innowacyjnej technologii oprogramowania opracowanej przez profesorów Rutgers-Camden, dr Catherine Grgicak i dr Desmond Lun. Technologia, zwana NOCIt, jest narzędziem obliczeniowym, które oblicza prawdopodobieństwo liczby współpracowników w profilu DNA.

„Jednym z wyzwań stojących przed laboratoriami kryminalistycznymi jest oszacowanie liczby współpracowników, która jest wymagana, zanim podejmą kolejny krok: obliczenie wagi dowodów przeciwko podejrzanemu” – powiedział Grgicak. „Wiele laboratoriów wciąż ręcznie szacuje tę liczbę współpracowników. To, co Desmond, ja i nasz zespół opracowaliśmy, to oprogramowanie, które ilościowo szacuje liczbę współpracowników. Wykorzystujemy tyle informacji, ile jest dostępnych, aby oszacować liczbę współpracowników”.

Lun dodał: „Wyniki z NOCIt zapewniają prawdopodobieństwo, ilu współpracowników istnieje w próbce. Na przykład może powiedzieć, że istnieje 60% prawdopodobieństwo, że jest trzech współtwórców, 20% prawdopodobieństwo, że jest dwóch współtwórców, i 20% prawdopodobieństwo, że jest jeden kontrybutor. Ale robi to, biorąc pod uwagę wiele punktów danych, usuwając w ten sposób jak najwięcej czynnika ludzkiego. Myślę, że wszyscy chcielibyśmy wiedzieć, że dowody przedstawiane na rozprawie są przetwarzane i analizowane w spójny sposób, a wyniki nie zależą od subiektywnych osądów, które mogłyby mieć znaczący wpływ na to, co zostanie zgłoszone”.

Dokładna ocena liczby współpracowników (NoC) w próbkach DNA ma kluczowe znaczenie w analizie kryminalistycznej. W artykule przeglądowym w ramach 20. Międzynarodowego Sympozjum Menedżerów Nauk Kryminalistycznych INTERPOL w 2019 r., uznany na całym świecie ekspert ds. kryminalistycznych analiz DNA, John Butler, stwierdził: „[a]ocena liczby współpracowników jest kluczowym elementem dokładnej interpretacji mieszaniny DNA”. Domena kryminalistyczna wykorzystuje obecnie powtarzalne sekwencje w ludzkim genomie zwane krótkimi powtórzeniami tandemowymi (STR). Jednak dokładne przewidywanie NoC jest trudne, zwłaszcza gdy próbki zawierają dużą liczbę współpracowników. Technologia opracowana przez Grgicaka i Luna dokładniej i pełniej identyfikuje liczbę składników w mieszaninie niż jakakolwiek istniejąca metoda.

Grgicak i Lun przetestowali działanie NOCIt w swoim artykule w czasopiśmie Forensic Science International: Genetics w 2020 r., używając 815 eksperymentalnych mieszanin DNA składających się z jednego do pięciu współpracowników oraz uszkodzonego i nieuszkodzonego DNA. NOCIt poprawnie zidentyfikował liczbę współpracowników w ponad 90% próbek eksperymentalnych i poprawił 28% błędnych szacunków dokonanych za pomocą najlepszej wcześniej istniejącej metody.

Zdaniem Grgicaka, najczęściej w kryminalistycznej analizie DNA laboratorium kryminalistyczne lub analityk będzie amplifikował DNA za pomocą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), która jest metodą amplifikacji określonych segmentów DNA poprzez tworzenie miliardów kopii poszczególnych fragmentów DNA lub genów, co pozwala analitykowi wykrywać i identyfikować sekwencje genów za pomocą technik wizualnych.

Wynik tego procesu laboratoryjnego nazywany jest elektroforogramem (wykres wyników analizy przeprowadzonej za pomocą automatycznego sekwencjonowania elektroforezy), który zawiera piki, które dostarczają informacji o potencjalnej tożsamości danej osoby. Jeśli jednak wielu współpracowników tworzy mieszaninę DNA pobranego z miejsca zbrodni, elektroforogram jest bardzo złożony, z wieloma pikami, a dokładna liczba współpracowników może być trudna do wywnioskowania naocznie lub przy użyciu innych metod ręcznych.

Współpraca Grgicaka i Luna narodziła się w Bostonie; ona była adiunktem w Boston University Chobanian & Avedisian School of Medicine, a on właśnie ukończył podobną pracę w Medard Lab na MIT. Ich technologia NOCIt, nad którą zaczęli wspólnie pracować w 2011 r., kiedy ona była w BU, a on był profesorem nadzwyczajnym w Rutgers-Camden, ma potencjał usprawnienia i ulepszenia procesu analizy kryminalistycznej DNA.

Według dyrektora ds. w kryminalistyce i analizie fragmentów Teresa Snyder-Leiby. „Dodając NOCIt do naszych produktów, jesteśmy teraz w stanie objąć wszystkie podstawy kryminalistycznej analizy DNA, ponieważ obliczenie liczby współpracowników jest największym problemem tak wielu laboratoriów”.

Biuro Badań zajmowało się negocjacjami i wykonaniem licencji.

„Biuro Badań było niezwykle pomocne podczas całego procesu” — powiedział Grgicak. „Za każdym razem, gdy mieliśmy pytanie, odpowiadali i bardzo pilnie dbali o to, aby Rutgers był dobrze reprezentowany. Posiadanie Office for Research jako łącznika między partnerem branżowym a PI było nieocenione”.

Lun zgodził się. „Nie moglibyśmy tego zrobić bez Biura Badań. Oboje z Catherine czuliśmy, że osiągnęliśmy poziom dojrzałości, z którym czujemy się komfortowo. Wyzwanie polegało na tym, że nie jesteśmy w stanie komercjalizować i szukaliśmy partnera, który zrobiłby kolejny krok z tą technologią”.

„Technologia opracowana przez Catherine i Desmonda ma potencjał usprawnienia procesu analizy DNA nie tylko w Stanach Zjednoczonych, ale także na całym świecie. pełniący obowiązki dyrektora wykonawczego Innovation Ventures.

Aby uzyskać więcej wiadomości biznesowych, odwiedź Nowości NJB teraz.

Powiązane artykuły: