Nauka i technika

Sztuczna inteligencja IndyGeneUS wprowadza medycynę genomową do niedostatecznie reprezentowanych populacji | przez StartUp Health | maj 2023 r

  • 19 maja, 2023
  • 10 min read
Sztuczna inteligencja IndyGeneUS wprowadza medycynę genomową do niedostatecznie reprezentowanych populacji |  przez StartUp Health |  maj 2023 r


Założyciel Yusuf Henriques i dyrektor naukowy dr Bradford Wilson połączyli swoje doświadczenie w FDA, wojsku i środowisku akademickim, aby kierować rozwojem terapii, które są skuteczne w niedostatecznie reprezentowanych populacjach.

Kondycja start-upów
Kondycja start-upów
inwestorzy, Naucz się jak możesz wesprzeć Health Transformers, takich jak zespół IndyGeneUS.

Podczas gdy COVID-19 był niszczycielski na całym świecie, był szczególnie szkodliwy dla społeczności kolorowych. Populacje Afroamerykanów, Latynosów i rdzennych Amerykanów doświadczyły podczas pandemii nieproporcjonalnie wyższych wskaźników infekcji i zgonów niż ich europejsko-amerykańskie odpowiedniki. Wynikało to częściowo z podstawowych nierówności w opiece zdrowotnej i zwiększonego ryzyka narażenia z powodu czynników społecznych i ekonomicznych. Chociaż te dysproporcje istniały przed COVID, pandemia je zaostrzyła i boleśnie pokazała, że ​​reforma opieki zdrowotnej nie jest już debatą polityczną, ale globalną koniecznością.

Jedną z przyczyn tych różnic zdrowotnych jest to, w jaki sposób i od kogo zbierane są dane do badań i opracowywania nowych leków. Historycznie banki danych DNA do badań genomicznych składały się w przeważającej mierze z mężczyzn rasy kaukaskiej, co oznacza, że ​​wiele populacji z całego świata nie ma reprezentacji w badaniach genomicznych. Obecnie 87% danych genomowych pochodzi od rasy białej, głównie męskiej. Oznacza to, że leki i terapie opracowywane na podstawie tych danych nie mają dokładnych biomarkerów dla zróżnicowanej populacji pacjentów, których mają leczyć.

Badania kliniczne napotykają podobne problemy związane z brakiem różnorodności. Afroamerykanie stanowią zaledwie 5% uczestników badań klinicznych, co stwarza martwe punkty na temat skuteczności leczenia. Każdy organizm metabolizuje leki w różnym tempie, w zależności od zestawu wariantów genetycznych i innych czynników, w tym wieku, płci, historii medycznej i innych czynników środowiskowych. Środowisko biomedyczne zdaje sobie sprawę z braku różnorodności w badaniach i próbach klinicznych, o czym świadczy nowa rekomendacja FDA, zgodnie z którą 25% uczestników badań klinicznych pochodzi z różnych populacji.

„Nawet jeśli uda się nakłonić ludzi do zapisania się na studia, istnieje ogromny odsetek mniejszości, ponieważ nie stać ich na transport ani na wyjazd z pracy na wizyty kontrolne” — wyjaśnia Yusuf N. Henriques, naukowiec interdyscyplinarny i były sanitariusz armii amerykańskiej.

Dostęp do opieki zdrowotnej był kolejnym ważnym czynnikiem powodującym obserwowane przez nas dysproporcje. Granice opieki zdrowotnej obejmują bariery społeczno-ekonomiczne, w tym ubezpieczenie zdrowotne, oraz bariery fizyczne, w tym odległość dla osób w społecznościach miejskich i wiejskich, odpowiednio, Agencje federalne, takie jak National Science Foundation, uruchomiły inicjatywy zachęcające do innowacji w zdecentralizowanych platformach opieki zdrowotnej skoncentrowanych na pacjencie, aby rozwiązać ten problem.

Henriques wie wszystko o wyzwaniach związanych z gromadzeniem danych zdrowotnych z różnych populacji. Jako były regulator FDA, przeglądał pakiety danych klinicznych dla urządzeń medycznych i produktów leczniczych, które miały zostać zatwierdzone. Pamięta, jak zauważył, że w tych badaniach brakowało udziału zróżnicowanej populacji pacjentów, nawet w przypadku produktów medycznych skierowanych głównie do pacjentów należących do mniejszości.

Warto przeczytać!  Badanie ujawnia genetyczną reakcję łańcuchową, która napędza rozprzestrzenianie się raka prostaty

„Ponieważ te próby kończą się wykorzystaniem danych, które pochodzą głównie od białych mężczyzn pochodzenia europejskiego, kończy się wiele prób i błędów, aby znaleźć odpowiednią skuteczną dawkę, powiedzmy, czarnej kobiety, która inaczej metabolizuje to ciśnienie krwi lub leki przeciwcukrzycowe” ”.

Kiedy wybuchła pandemia, Henriques przebywał w Nowym Jorku w ramach kohorty 2020 Apex, dziewięciomiesięcznego inkubatora w Veterans Future Lab na Uniwersytecie Nowojorskim. W tym czasie skupiał się na swoim przedsięwzięciu TruGenomix Health, Inc. (działającym jako Polaris Genomics), pierwszej firmie zajmującej się genomiką należącej do Czarnych w Stanach Zjednoczonych. Założył firmę po tym, jak opiekun obozów letnich jego córek bliźniaczek, żołnierz piechoty morskiej USA, popełnił samobójstwo. To właśnie w TruGenomix jego obecny dyrektor naukowy, dr Bradford Wilson, opracował test ekspresji genu zespołu stresu pourazowego (TruGen-1), po uzyskaniu wyłącznych praw do patentu od stowarzyszenia Henriquesa z Icahn School of Medicine w Mount Sinai (ISMMS ) Klinika Psychiatrii. Obecnie test ekspresji genów pomaga zidentyfikować osoby, które mogą być w grupie wysokiego ryzyka PTSD, lęku, depresji i choroby afektywnej dwubiegunowej. Niedawno firma Polaris otrzymała 1,25 miliona dolarów w ramach badań DoD Small Business Innovation Research (SBIR) firmy AFWERX na kontynuację innowacji i przyspieszenie badań nad precyzyjnymi rozwiązaniami w zakresie zdrowia psychicznego w celu udoskonalenia badań przesiewowych i leczenia tych schorzeń.

W szczytowym okresie COVID-19 opuścił Nowy Jork, aby schronić się u swojej rodziny w Maryland, a następnie szybko znalazł się w różnych grupach zadaniowych zajmujących się problemami logistycznymi związanymi z COVID-19, takimi jak dystrybucja respiratorów i niedobory zaopatrzenia. Robił to, co zawsze, najpierw jako wojskowy medyk bojowy, a potem w służbie rządowej: odpowiadał na pilną potrzebę, przed którą stał. Wtedy MIT zaoferował mu możliwość współtworzenia hackathonu skupionego na likwidacji niesprawiedliwości rasowej w systemach opieki zdrowotnej.

Wyzwanie MIT Hacking Racism in Healthcare Challenge rozpoczęło się we wrześniu 2020 r. Jedną z branż, do której się odnosił, był brak różnorodności w badaniach klinicznych, który stał się bardziej naglący ze względu na sprint do opracowania leków na COVID, które działały dobrze dla osób kolorowych, które najprawdopodobniej były zarazić się i umrzeć na COVID-19. W październiku tego roku Henriques wpadł na pomysł IndyGeneUS.

„MIT dostarczył nam platformę i początkową sieć, aby wykorzystać genomikę do rozwiązania tych dysproporcji zdrowotnych, na które zwrócił uwagę COVID. Wymyśliliśmy namacalne sposoby rozwiązania problemu braku reprezentacji w badaniach klinicznych, istniejących barier w dostępie oraz bezpiecznego kompilowania bardziej zróżnicowanych danych pacjentów i tworzenia szczepionek/leków, które działają dla większej liczby osób”.

Warto przeczytać!  Mutacja genetyczna związana z dziedziczną paraplegią spastyczną

IndyGeneUS (wymawiane jako „rodzimy”) to firma zajmująca się medycyną precyzyjną, wykorzystująca technologie sekwencjonowania nowej generacji do identyfikacji unikalnych wariantów genów w chorobach dotykających niedostatecznie reprezentowane populacje. Łącząc zorientowane na pacjenta podejście i filozofię z zastrzeżoną platformą precyzyjnego odkrywania zdrowia zaszyfrowaną łańcuchem bloków, IndyGeneUS chce stać się zaufanym źródłem dostarczania wysokiej jakości i wiarygodnych informacji na temat chorób, a także rozwoju terapii molekularnych i komórkowych oraz bioprzetwarzania, które obejmuje populacji niedostatecznie reprezentowanych w badaniach genetycznych.

„Rozwiązujemy problem danych dla tych społeczności I zająć się kwestią zaufania. Oznacza to, że musimy iść tam, gdzie są ludzie i nie utrudniać im uczestnictwa. Potrzebujemy laboratoriów w „kapturach”. Potrzebujemy komunikacji w zakresie wiedzy o zdrowiu w zakładach fryzjerskich i na rogach ulic”.

W tym celu IndyGeneUS założyło swoje pierwsze amerykańskie laboratorium w historycznym kampusie starego Walter Reed Medical Center, na Georgia Avenue w Waszyngtonie. Ta lokalizacja pomogła ustalić ich misję i model oraz ma wartość sentymentalną dla Henriquesa, który spacerował po korytarzach podczas swoich wojskowych dni. Celowo lokując swoje usługi w ośrodku miejskim, firma dba o to, aby badania kliniczne i testy genetyczne odbywały się w komfortowych, znanych mieszkańcom warunkach i przyciągały pracowników z tej samej społeczności.

IndyGeneUS zaczęło od skoncentrowania się na jednej z największych niedostatecznie reprezentowanych grup, kiedy utworzyło Women’s Health Research Collaborative. We współpracy z Endo Black, Inc., PCOS Challenge: The National Polycystic Ovary Syndrome Association i The White Dress Project, IndyGeneUS bada genetykę endometriozy, PCOS i mięśniaków macicy w różnych populacjach kobiet dotkniętych chorobą.

IndyGeneUS CSO, dr Bradford Wilson, wyjaśnia: „To partnerstwo daje nam potencjał pozytywnego wpływu na ponad 90% kobiet ze wszystkich grup etnicznych, które cierpią na co najmniej jedną z tych chorób. Nasi partnerzy zajmujący się rzecznictwem mówią nam, że są kobiety dotknięte wszystkimi trzema z tych schorzeń i może istnieć genetyczne wyjaśnienie”.

Na froncie globalnym IndyGeneUS rozszerzyło już swoją działalność na kontynent afrykański. W zeszłym roku IndyGeneUS nawiązał partnerstwo publiczno-prywatne z Global Health Innovations (GHI), która jest spółką zależną The Aurum Institute NPC (Aurum) z siedzibą w Johannesburgu w RPA. Oczekuje się, że ta współpraca przyspieszy zdolność IndyGeneUS do zaangażowania nawet dwóch milionów pacjentów, zapisania uczestników do badań naukowych i umożliwi Afrykanom bezpieczny dostęp, kontrolę i zarządzanie ich danymi genomicznymi i medycznymi w ramach platformy IndyGeneUS Precision Health Discovery. Drugie laboratorium IndyGeneUS znajduje się w rejonie Woodstock w Kapsztadzie, który jest historycznie miejski. Tworząc największe na świecie repozytorium rdzennych i diasporycznych afrykańskich danych klinicznych i genomicznych oraz stosując własne algorytmy AI/ML, które integrują dane multiomiczne, elektroniczną dokumentację medyczną i najnowszą literaturę naukową, IndyGeneUS planuje przyspieszyć odkrycie , rozwój i produkcja precyzyjnych środków terapeutycznych dla różnych populacji. To sprawiedliwość zdrowotna w skali globalnej, która odnosi się do różnic w dostępie i informacji, z jakimi borykają się afrykańskie populacje diaspory na całym świecie.

Warto przeczytać!  Profilaktyka raka jelita grubego | Moffitta

StartUp Health z dumą wspiera IndyGeneUS w ich misji kierowania medycyną precyzyjną w kierunku większej równości ze względu na ich skoncentrowane na społeczności, kompleksowe podejście, które tworzy, gromadzi i kodyfikuje różnorodne dane genomiczne w celu napędzania prawdziwych zmian. Myśląc zarówno lokalnie, jak i globalnie, są w stanie lepiej zaradzić istniejącym rozbieżnościom, jeśli chodzi o to, jaki rodzaj materiału genetycznego jest dostępny do odkrywania leków oraz w jaki sposób testowane i sprawdzane są nowe terapie.

Ten sposób myślenia zapewnił im już strategiczne partnerstwa i wsparcie w celu napędzania szybkiego wzrostu w nadchodzącym roku, czyniąc z nich firmę godną uwagi w dziedzinie genomiki. Firma Johnson & Johnson nawiązała z nimi współpracę, aby wesprzeć ich pierwsze laboratorium w Waszyngtonie w wyniku ich szybkiego wyzwania, a firma Merck zaprosiła ich do dołączenia do kohorty Digital Science Studio Accelerator Cohort w czwartym kwartale 2022 r. Rozpoczęła się już budowa ich pierwszego ośrodka sekwencjonowania w Afryce Południowej, co jest wynikiem kilku relacji z uniwersytetami i organizacjami zdrowotnymi.

Ponadto z dumą wspieramy dynamiczny zespół odpowiedzialny za tę pracę. Yusuf Henriques ma ponad 20-letnie doświadczenie w prowadzeniu badań klinicznych, analizie danych i ocenie leków, a także w kilku start-upach. Jego współzałożyciel i CSO, genetyk dr Bradford Wilson, wnosi do firmy ponad 15 lat badań nad dysproporcjami zdrowotnymi i doświadczeniem w sekwencjonowaniu genetycznym. IndyGeneUS wykorzystuje również doświadczenie dyrektora medycznego Gordona Taylora, MD, certyfikowanego lekarza medycyny ratunkowej, do nadzorowania klinicznego zastosowania danych i komunikacji eksperckiej oraz stratega marki Angela N. Livasa jako dyrektora ds. komunikacji. Ta grupa łączy dziesięciolecia osiągnięć w swoich dziedzinach ze wspólną pasją, aby opieka zdrowotna była bardziej sprawiedliwa.

Dołącz do nas, witając IndyGeneUS w rodzinie StartUp Health. Nie możemy się doczekać, aby zobaczyć, jak ich wkład w badania i rozwój leków pomoże poprawić wyniki zdrowotne wszyscy.


Źródło