Sztuczna inteligencja IndyGeneUS wprowadza medycynę genomową do niedostatecznie reprezentowanych populacji | przez StartUp Health | maj 2023 r
![Sztuczna inteligencja IndyGeneUS wprowadza medycynę genomową do niedostatecznie reprezentowanych populacji | przez StartUp Health | maj 2023 r](https://oen.pl/wp-content/uploads/2023/05/1-0sif-GdGUn7ezowy0IZwQ-770x470.jpeg)
Założyciel Yusuf Henriques i dyrektor naukowy dr Bradford Wilson połączyli swoje doświadczenie w FDA, wojsku i środowisku akademickim, aby kierować rozwojem terapii, które są skuteczne w niedostatecznie reprezentowanych populacjach.
![Kondycja start-upów](https://oen.pl/wp-content/uploads/2023/05/Sztuczna-inteligencja-IndyGeneUS-wprowadza-medycyne-genomowa-do-niedostatecznie-reprezentowanych-populacji.png)
![Kondycja start-upów](https://oen.pl/wp-content/uploads/2023/05/1684467974_655_Sztuczna-inteligencja-IndyGeneUS-wprowadza-medycyne-genomowa-do-niedostatecznie-reprezentowanych-populacji.png)
Podczas gdy COVID-19 był niszczycielski na całym świecie, był szczególnie szkodliwy dla społeczności kolorowych. Populacje Afroamerykanów, Latynosów i rdzennych Amerykanów doświadczyły podczas pandemii nieproporcjonalnie wyższych wskaźników infekcji i zgonów niż ich europejsko-amerykańskie odpowiedniki. Wynikało to częściowo z podstawowych nierówności w opiece zdrowotnej i zwiększonego ryzyka narażenia z powodu czynników społecznych i ekonomicznych. Chociaż te dysproporcje istniały przed COVID, pandemia je zaostrzyła i boleśnie pokazała, że reforma opieki zdrowotnej nie jest już debatą polityczną, ale globalną koniecznością.
Jedną z przyczyn tych różnic zdrowotnych jest to, w jaki sposób i od kogo zbierane są dane do badań i opracowywania nowych leków. Historycznie banki danych DNA do badań genomicznych składały się w przeważającej mierze z mężczyzn rasy kaukaskiej, co oznacza, że wiele populacji z całego świata nie ma reprezentacji w badaniach genomicznych. Obecnie 87% danych genomowych pochodzi od rasy białej, głównie męskiej. Oznacza to, że leki i terapie opracowywane na podstawie tych danych nie mają dokładnych biomarkerów dla zróżnicowanej populacji pacjentów, których mają leczyć.
Badania kliniczne napotykają podobne problemy związane z brakiem różnorodności. Afroamerykanie stanowią zaledwie 5% uczestników badań klinicznych, co stwarza martwe punkty na temat skuteczności leczenia. Każdy organizm metabolizuje leki w różnym tempie, w zależności od zestawu wariantów genetycznych i innych czynników, w tym wieku, płci, historii medycznej i innych czynników środowiskowych. Środowisko biomedyczne zdaje sobie sprawę z braku różnorodności w badaniach i próbach klinicznych, o czym świadczy nowa rekomendacja FDA, zgodnie z którą 25% uczestników badań klinicznych pochodzi z różnych populacji.
„Nawet jeśli uda się nakłonić ludzi do zapisania się na studia, istnieje ogromny odsetek mniejszości, ponieważ nie stać ich na transport ani na wyjazd z pracy na wizyty kontrolne” — wyjaśnia Yusuf N. Henriques, naukowiec interdyscyplinarny i były sanitariusz armii amerykańskiej.
Dostęp do opieki zdrowotnej był kolejnym ważnym czynnikiem powodującym obserwowane przez nas dysproporcje. Granice opieki zdrowotnej obejmują bariery społeczno-ekonomiczne, w tym ubezpieczenie zdrowotne, oraz bariery fizyczne, w tym odległość dla osób w społecznościach miejskich i wiejskich, odpowiednio, Agencje federalne, takie jak National Science Foundation, uruchomiły inicjatywy zachęcające do innowacji w zdecentralizowanych platformach opieki zdrowotnej skoncentrowanych na pacjencie, aby rozwiązać ten problem.
Henriques wie wszystko o wyzwaniach związanych z gromadzeniem danych zdrowotnych z różnych populacji. Jako były regulator FDA, przeglądał pakiety danych klinicznych dla urządzeń medycznych i produktów leczniczych, które miały zostać zatwierdzone. Pamięta, jak zauważył, że w tych badaniach brakowało udziału zróżnicowanej populacji pacjentów, nawet w przypadku produktów medycznych skierowanych głównie do pacjentów należących do mniejszości.
„Ponieważ te próby kończą się wykorzystaniem danych, które pochodzą głównie od białych mężczyzn pochodzenia europejskiego, kończy się wiele prób i błędów, aby znaleźć odpowiednią skuteczną dawkę, powiedzmy, czarnej kobiety, która inaczej metabolizuje to ciśnienie krwi lub leki przeciwcukrzycowe” ”.
Kiedy wybuchła pandemia, Henriques przebywał w Nowym Jorku w ramach kohorty 2020 Apex, dziewięciomiesięcznego inkubatora w Veterans Future Lab na Uniwersytecie Nowojorskim. W tym czasie skupiał się na swoim przedsięwzięciu TruGenomix Health, Inc. (działającym jako Polaris Genomics), pierwszej firmie zajmującej się genomiką należącej do Czarnych w Stanach Zjednoczonych. Założył firmę po tym, jak opiekun obozów letnich jego córek bliźniaczek, żołnierz piechoty morskiej USA, popełnił samobójstwo. To właśnie w TruGenomix jego obecny dyrektor naukowy, dr Bradford Wilson, opracował test ekspresji genu zespołu stresu pourazowego (TruGen-1), po uzyskaniu wyłącznych praw do patentu od stowarzyszenia Henriquesa z Icahn School of Medicine w Mount Sinai (ISMMS ) Klinika Psychiatrii. Obecnie test ekspresji genów pomaga zidentyfikować osoby, które mogą być w grupie wysokiego ryzyka PTSD, lęku, depresji i choroby afektywnej dwubiegunowej. Niedawno firma Polaris otrzymała 1,25 miliona dolarów w ramach badań DoD Small Business Innovation Research (SBIR) firmy AFWERX na kontynuację innowacji i przyspieszenie badań nad precyzyjnymi rozwiązaniami w zakresie zdrowia psychicznego w celu udoskonalenia badań przesiewowych i leczenia tych schorzeń.
W szczytowym okresie COVID-19 opuścił Nowy Jork, aby schronić się u swojej rodziny w Maryland, a następnie szybko znalazł się w różnych grupach zadaniowych zajmujących się problemami logistycznymi związanymi z COVID-19, takimi jak dystrybucja respiratorów i niedobory zaopatrzenia. Robił to, co zawsze, najpierw jako wojskowy medyk bojowy, a potem w służbie rządowej: odpowiadał na pilną potrzebę, przed którą stał. Wtedy MIT zaoferował mu możliwość współtworzenia hackathonu skupionego na likwidacji niesprawiedliwości rasowej w systemach opieki zdrowotnej.
Wyzwanie MIT Hacking Racism in Healthcare Challenge rozpoczęło się we wrześniu 2020 r. Jedną z branż, do której się odnosił, był brak różnorodności w badaniach klinicznych, który stał się bardziej naglący ze względu na sprint do opracowania leków na COVID, które działały dobrze dla osób kolorowych, które najprawdopodobniej były zarazić się i umrzeć na COVID-19. W październiku tego roku Henriques wpadł na pomysł IndyGeneUS.
„MIT dostarczył nam platformę i początkową sieć, aby wykorzystać genomikę do rozwiązania tych dysproporcji zdrowotnych, na które zwrócił uwagę COVID. Wymyśliliśmy namacalne sposoby rozwiązania problemu braku reprezentacji w badaniach klinicznych, istniejących barier w dostępie oraz bezpiecznego kompilowania bardziej zróżnicowanych danych pacjentów i tworzenia szczepionek/leków, które działają dla większej liczby osób”.
IndyGeneUS (wymawiane jako „rodzimy”) to firma zajmująca się medycyną precyzyjną, wykorzystująca technologie sekwencjonowania nowej generacji do identyfikacji unikalnych wariantów genów w chorobach dotykających niedostatecznie reprezentowane populacje. Łącząc zorientowane na pacjenta podejście i filozofię z zastrzeżoną platformą precyzyjnego odkrywania zdrowia zaszyfrowaną łańcuchem bloków, IndyGeneUS chce stać się zaufanym źródłem dostarczania wysokiej jakości i wiarygodnych informacji na temat chorób, a także rozwoju terapii molekularnych i komórkowych oraz bioprzetwarzania, które obejmuje populacji niedostatecznie reprezentowanych w badaniach genetycznych.
„Rozwiązujemy problem danych dla tych społeczności I zająć się kwestią zaufania. Oznacza to, że musimy iść tam, gdzie są ludzie i nie utrudniać im uczestnictwa. Potrzebujemy laboratoriów w „kapturach”. Potrzebujemy komunikacji w zakresie wiedzy o zdrowiu w zakładach fryzjerskich i na rogach ulic”.
W tym celu IndyGeneUS założyło swoje pierwsze amerykańskie laboratorium w historycznym kampusie starego Walter Reed Medical Center, na Georgia Avenue w Waszyngtonie. Ta lokalizacja pomogła ustalić ich misję i model oraz ma wartość sentymentalną dla Henriquesa, który spacerował po korytarzach podczas swoich wojskowych dni. Celowo lokując swoje usługi w ośrodku miejskim, firma dba o to, aby badania kliniczne i testy genetyczne odbywały się w komfortowych, znanych mieszkańcom warunkach i przyciągały pracowników z tej samej społeczności.
IndyGeneUS zaczęło od skoncentrowania się na jednej z największych niedostatecznie reprezentowanych grup, kiedy utworzyło Women’s Health Research Collaborative. We współpracy z Endo Black, Inc., PCOS Challenge: The National Polycystic Ovary Syndrome Association i The White Dress Project, IndyGeneUS bada genetykę endometriozy, PCOS i mięśniaków macicy w różnych populacjach kobiet dotkniętych chorobą.
IndyGeneUS CSO, dr Bradford Wilson, wyjaśnia: „To partnerstwo daje nam potencjał pozytywnego wpływu na ponad 90% kobiet ze wszystkich grup etnicznych, które cierpią na co najmniej jedną z tych chorób. Nasi partnerzy zajmujący się rzecznictwem mówią nam, że są kobiety dotknięte wszystkimi trzema z tych schorzeń i może istnieć genetyczne wyjaśnienie”.
Na froncie globalnym IndyGeneUS rozszerzyło już swoją działalność na kontynent afrykański. W zeszłym roku IndyGeneUS nawiązał partnerstwo publiczno-prywatne z Global Health Innovations (GHI), która jest spółką zależną The Aurum Institute NPC (Aurum) z siedzibą w Johannesburgu w RPA. Oczekuje się, że ta współpraca przyspieszy zdolność IndyGeneUS do zaangażowania nawet dwóch milionów pacjentów, zapisania uczestników do badań naukowych i umożliwi Afrykanom bezpieczny dostęp, kontrolę i zarządzanie ich danymi genomicznymi i medycznymi w ramach platformy IndyGeneUS Precision Health Discovery. Drugie laboratorium IndyGeneUS znajduje się w rejonie Woodstock w Kapsztadzie, który jest historycznie miejski. Tworząc największe na świecie repozytorium rdzennych i diasporycznych afrykańskich danych klinicznych i genomicznych oraz stosując własne algorytmy AI/ML, które integrują dane multiomiczne, elektroniczną dokumentację medyczną i najnowszą literaturę naukową, IndyGeneUS planuje przyspieszyć odkrycie , rozwój i produkcja precyzyjnych środków terapeutycznych dla różnych populacji. To sprawiedliwość zdrowotna w skali globalnej, która odnosi się do różnic w dostępie i informacji, z jakimi borykają się afrykańskie populacje diaspory na całym świecie.
StartUp Health z dumą wspiera IndyGeneUS w ich misji kierowania medycyną precyzyjną w kierunku większej równości ze względu na ich skoncentrowane na społeczności, kompleksowe podejście, które tworzy, gromadzi i kodyfikuje różnorodne dane genomiczne w celu napędzania prawdziwych zmian. Myśląc zarówno lokalnie, jak i globalnie, są w stanie lepiej zaradzić istniejącym rozbieżnościom, jeśli chodzi o to, jaki rodzaj materiału genetycznego jest dostępny do odkrywania leków oraz w jaki sposób testowane i sprawdzane są nowe terapie.
Ten sposób myślenia zapewnił im już strategiczne partnerstwa i wsparcie w celu napędzania szybkiego wzrostu w nadchodzącym roku, czyniąc z nich firmę godną uwagi w dziedzinie genomiki. Firma Johnson & Johnson nawiązała z nimi współpracę, aby wesprzeć ich pierwsze laboratorium w Waszyngtonie w wyniku ich szybkiego wyzwania, a firma Merck zaprosiła ich do dołączenia do kohorty Digital Science Studio Accelerator Cohort w czwartym kwartale 2022 r. Rozpoczęła się już budowa ich pierwszego ośrodka sekwencjonowania w Afryce Południowej, co jest wynikiem kilku relacji z uniwersytetami i organizacjami zdrowotnymi.
Ponadto z dumą wspieramy dynamiczny zespół odpowiedzialny za tę pracę. Yusuf Henriques ma ponad 20-letnie doświadczenie w prowadzeniu badań klinicznych, analizie danych i ocenie leków, a także w kilku start-upach. Jego współzałożyciel i CSO, genetyk dr Bradford Wilson, wnosi do firmy ponad 15 lat badań nad dysproporcjami zdrowotnymi i doświadczeniem w sekwencjonowaniu genetycznym. IndyGeneUS wykorzystuje również doświadczenie dyrektora medycznego Gordona Taylora, MD, certyfikowanego lekarza medycyny ratunkowej, do nadzorowania klinicznego zastosowania danych i komunikacji eksperckiej oraz stratega marki Angela N. Livasa jako dyrektora ds. komunikacji. Ta grupa łączy dziesięciolecia osiągnięć w swoich dziedzinach ze wspólną pasją, aby opieka zdrowotna była bardziej sprawiedliwa.
Dołącz do nas, witając IndyGeneUS w rodzinie StartUp Health. Nie możemy się doczekać, aby zobaczyć, jak ich wkład w badania i rozwój leków pomoże poprawić wyniki zdrowotne wszyscy.