Nauka i technika

Tłumaczenie i stosowanie genomowych EPD

  • 1 lutego, 2023
  • 3 min read
Tłumaczenie i stosowanie genomowych EPD


Oczekiwane różnice potomstwa (EPD) są szeroko stosowanym narzędziem w podejmowaniu decyzji genetycznych skoncentrowanych na celach hodowlanych. Wraz z postępem technologii DNA przemysł był w stanie włączyć genomikę do liczb używanych do obliczania EPD. Przed włączeniem informacji genomowych polegaliśmy na relacjach opartych na rodowodzie, które działają na średnich. Zakłada to 50% wkład matki i 50% wkład ojca w wartość hodowlaną potomstwa. Jednak rzeczywista wartość genetyczna zwierzęcia lub jego wartość EPD dla danej cechy może być większa lub mniejsza niż wartość jego rodziców, w zależności od tego, w jaki sposób liczne przypadkowe kombinacje materiału genetycznego wniesionego przez ojca i matkę łączą się i są wyrażane w potomstwie .

Brakującym elementem historycznych założeń genetycznych jest dokładność. Ponieważ buhaj płodzi więcej potomstwa, a te zapisy zostały zgłoszone, EPD zmieniłyby się, aby odzwierciedlić wydajność potomstwa, a dokładność wzrosła. Dzięki uwzględnieniu informacji genomicznych w obliczeniach EPD zwiększa się dokładność młodszych buhajów. W przypadku EPD z dużą liczbą zapisów, takich jak masa urodzeniowa, genomika może być równoznaczna z posiadaniem już 25 zapisów dotyczących potomstwa tego zwierzęcia, zanim kiedykolwiek wyhodowano krowę.

Warto przeczytać!  Program medyczny poszukuje miliona osób w celu poprawy zdrowia różnych grup etnicznych. Jak mieszkańcy doliny mogą pomóc

Metody pobierania próbek do pobierania tkanek w celu identyfikacji składu genetycznego zwierzęcia mogą obejmować próbki krwi, próbki włosów lub próbki tkanek, takie jak nakłucia uszne. Zbierając próbki DNA od cielęcia i jego rodziców, możemy lepiej oszacować, w jaki sposób zwierzę odnosi się do każdego z rodziców, a nawet dziadków, na poziomie genotypu. Takie zrozumienie daje większą dokładność poznania EPD młodych zwierząt, co daje większą precyzję przewidywania wpływu na wydajność przyszłego potomstwa.

Tabela 1 zawiera porównanie cieląt buhajów (bliźniaków) z pełnego rodzeństwa, które reprezentują genetykę tego samego reproduktora i matki, które zostały przetestowane pod kątem DNA i te informacje wykorzystano do obliczenia ich EPD.

Genomic-EPD-Comparison.jpg

W tym porównaniu możemy zobaczyć, że te byki są podobne w CED, WW, YW i Milk dla niektórych przykładów. W przeciwieństwie do tego, możemy zobaczyć, gdzie te byki różnią się w SC, MW i Doc. Różnice i podobieństwa są odzwierciedlone w porównaniach wartości $ byków. Cielę nr 1 pokazuje możliwości bycia lepszym wyborem, jeśli chce zatrzymać samice (mln $). Z drugiej strony, gdyby zachować własność cieląt w okresie tuczu i sprzedawać jako żywe zwierzę, cielę nr 2 dałoby potomstwo o wyższym potencjale zysku.

Warto przeczytać!  Zasoby Myriad Genetics: Nie oczekuj przełomów

EPD wzmocnione genomem to najlepsze oszacowanie wartości genetycznej zwierzęcia jako rodzica, łączące wszystkie dostępne źródła informacji. Pozwala to na wyższą dokładność EPD na młodszych zwierzętach. Dzięki włączeniu genomiki możemy lepiej zrozumieć, w jaki sposób potomstwo odnosi się do swoich rodziców z cechy na cechę, co stwarza szansę na większą pewność, że selekcje kojarzone będą postępować w kierunku celów hodowlanych szybciej i zgodnie z zamierzeniami.


Źródło