Bengaluru: Naukowcy badający epidemię choroby guzowatej skóry guzowatej w Indiach, w wyniku której od 2022 r. zginęło ponad lakh bydła, ustalili, że jej ciężkość wynika z niezwykle dużej liczby zmian genetycznych w szczepie wirusa choroby guzowatej skóry (LSDV). Wybuch epidemii poważnie dotknął indyjski sektor rolniczy i spowodował oszałamiające straty gospodarcze.

Wieloinstytucjonalny zespół naukowców odkrył ponad 1800 odmian genetycznych, w tym dużą liczbę odmian genów wirusowych kluczowych dla wiązania się z komórkami gospodarza, unikania odpowiedzi immunologicznej i skutecznej replikacji. Prawdopodobnie zwiększyło to zdolność wirusa do wywoływania chorób. Wyniki ich badania opublikowano w czasopiśmie BMC Genomics.

„U bydła wystąpiły poważniejsze objawy na obszarach, na których znaleźliśmy bardzo zróżnicowane szczepy. Sugeruje to, że różnice genetyczne mogą zwiększać zjadliwość” – stwierdziła Ankeet Kumar, doktorantka w Indyjskim Instytucie Nauki (IISc) i współautorka badania. .

Zespół we współpracy z instytutami weterynaryjnymi pobrał guzki skórne, krew i wymazy z nosa od zakażonego bydła w stanach takich jak Gujarat, Maharasztra, Radżastan i Karnataka, a następnie przeprowadził zaawansowane sekwencjonowanie DNA całego genomu pobranego z 22 próbek.

Kumar powiedział, że brak ustalonego schematu sekwencjonowania i analizy genomu LSDV stanowi poważne wyzwanie, zmuszając zespół do dostosowania technik uzyskanych w badaniach nad COVID-19.

Analiza genomu ujawniła dwa różne warianty LSDV krążące w Indiach, jeden o niskiej, a drugi o dużej liczbie odmian genetycznych; ten ostatni okazał się podobny do szczepów LSDV z epidemii w Rosji w 2015 roku.

Kumar powiedział, że nie było wcześniejszych doniesień o tak bardzo zróżnicowanych szczepach LSDV w Indiach. Wirusy z DNA jako materiałem genetycznym, takie jak LSDV, są na ogół bardziej stabilne niż wirusy RNA. „Dlatego znalezienie tak wielu różnic genetycznych było dość zaskakujące i mogło wyjaśnić ciężkość choroby” – powiedział.

Wnioski z badania mogą pomóc w udoskonaleniu diagnostyki, szczepionek i interwencji w walce z pojawiającymi się chorobami zakaźnymi zagrażającymi zwierzętom hodowlanym, twierdzi IISc.

Utpal Tatu, profesor na Wydziale Biochemii IISc i członek zespołu, powiedział, że dane genomiczne okażą się „bezcenne” w opracowaniu szczepionki, ujawniając molekularne punkty aktywne i zmiany genetyczne, na które należy zwrócić uwagę. Jego grupa badawcza przeprowadziła podobne badania nad COVID-19 podczas pandemii. „To pierwszy przypadek scharakteryzowania krajobrazu genomowego LSDV podczas wybuchu epidemii w Indiach na skalę krajową” – powiedział.

IISc stwierdziła, że ​​badanie stanowi przykład podejścia „Jedno zdrowie”, w ramach którego multidyscyplinarne zespoły, w tym biolodzy molekularni, eksperci obliczeniowi i lekarze weterynarii, spotykają się, aby zająć się kwestiami o znaczeniu krajowym.

Infekcja wirusowa wywołana przez LSDV. Choroba przenoszona jest przez owady, takie jak muchy i komary. Powoduje gorączkę i guzki na skórze i może być śmiertelna dla bydła. Wirus, występujący do 1989 r. w regionie subafrykańskim, później rozprzestrzenił się na Bliski Wschód, Rosję i inne kraje Europy Południowo-Wschodniej oraz Azję Południową. Indie zgłosiły dwie duże ogniska choroby w latach 2019 i 2022. Ta ostatnia zainfekowała ponad dwa miliony krów.