W próbkach pacjentów odkryto ponad 30 nowych gatunków bakterii
Dziękuję. Posłuchaj tego artykułu, korzystając z odtwarzacza powyżej. ✖
Chcesz posłuchać tego artykułu ZA DARMO?
Wypełnij poniższy formularz, aby odblokować dostęp do WSZYSTKICH artykułów audio.
Infekcje bakteryjne można leczyć skuteczniej, jeśli znana jest przyczyna choroby. W większości przypadków wystarczy analiza w laboratorium medycznym, aby zidentyfikować patogen. Czasami jednak standardowe metody są niewystarczające – np. jeśli gatunek bakterii nie został jeszcze sklasyfikowany lub jest szczególnie trudny w hodowli.
Zespół z Uniwersytetu w Bazylei i Szpitala Uniwersyteckiego w Bazylei od 2014 r. zbiera i analizuje próbki pacjentów zawierające takie nieznane zarazki. Naukowcy odkryli ponad trzydzieści nowych gatunków bakterii, z których niektóre są powiązane z klinicznie istotnymi infekcjami.
Pełna analiza genetyczna
W sumie zespół kierowany przez mikrobiologa dr Daniela Goldenbergera przeanalizował 61 nieznanych patogenów bakteryjnych znalezionych w próbkach krwi lub tkanek od pacjentów cierpiących na różnorodne schorzenia. Konwencjonalne metody laboratoryjne, takie jak spektroskopia mas lub sekwencjonowanie niewielkiej części genomu bakteryjnego, nie dały wyników w przypadku wszystkich tych izolatów. Dlatego naukowcy zsekwencjonowali cały materiał genetyczny bakterii, stosując metodę dostępną dopiero od kilku lat. Następnie porównali zidentyfikowane sekwencje genomu ze znanymi szczepami za pomocą narzędzia internetowego.
Spośród 61 przeanalizowanych bakterii 35 było wcześniej nieznanych. Naukowcy sklasyfikowali pozostałe 26 szczepów jako trudne do zidentyfikowania: albo sekwencje ich genomu zostały dodane do baz danych niedawno, albo dopiero niedawno stworzono prawidłowy opis taksonomiczny patogenów. Ocena danych pacjentów wykazała, że siedem z 35 nowych szczepów miało znaczenie kliniczne, co oznacza, że mogą powodować zakażenia bakteryjne u ludzi. „W przeszłości rzadko publikowano takie bezpośrednie powiązania między nowo zidentyfikowanymi gatunkami bakterii a ich znaczeniem klinicznym” – stwierdził dr Goldenberger.
Przyczyna rzadkich infekcji
Większość nowo zidentyfikowanych gatunków należy do tzw Corynebakteria I Schaalia rodzaje, obie pałeczki Gram-dodatnie. „Wiele gatunków z tych dwóch rodzajów występuje w naturalnym mikrobiomie ludzkiej skóry i błonie śluzowej. Dlatego często są one niedoceniane, a badania na ich temat są skąpe” – wyjaśnia dr Goldenberger. Mogą jednak powodować infekcje, gdy dostaną się do krwioobiegu – na przykład z powodu nowotworu.
Jeden z trudnych do zidentyfikowania patogenów może mieć również znaczenie kliniczne. Znaleziono go w zapalonym kciuku pacjenta po ukąszeniu przez psa. Kanadyjska grupa badawcza również niedawno wyizolowała tę bakterię z ran spowodowanych ukąszeniami psów lub kotów. „To doprowadziło nas do założenia, że jest to nowy patogen, który musimy monitorować” – stwierdził dr Goldenberger. Kanadyjscy badacze odpowiednio nazwali tę bakterię Vandammella Animalimorsus (ukąszenie zwierzęcia Vandammella) w 2022 r.
Nadanie nazw nowym gatunkom jest także kolejnym punktem na liście zadań zespołu z Bazylei. Ściśle współpracują z profesorem Peterem Vandamme z Uniwersytetu w Gandawie, specjalistą w dziedzinie klasyfikacji bakterii. Dwie z bakterii zostały już nazwane. Jeden jest Pseudoclavibacter triregionum – nawiązując do położenia Bazylei w pobliżu granic Szwajcarii, Francji i Niemiec.
Projekt rozpoczęty przez zespół Daniela Goldenbergera nie jest jednak jeszcze ukończony. Naukowcy w dalszym ciągu systematycznie zbierają i sekwencjonują nieznane patogeny znalezione w próbkach pacjentów ze Szpitala Uniwersyteckiego w Bazylei – wykryto już ponad dwadzieścia nowych gatunków. „Zauważyliśmy tutaj dużą dynamikę: dzięki postępowi technologicznemu w bakteriologii publikuje się znacznie więcej na temat nowo odkrytych gatunków bakterii” – wyjaśnił dr Goldenberger. Rozwój ten ułatwi w przyszłości prawidłowe diagnozowanie infekcji wywołanych rzadkimi patogenami i skuteczne ich leczenie od samego początku.
Odniesienie: Muigg V, Seth-Smith HMB, Adam KM i in. Badanie weryfikacyjne i analityczne nowatorskich organizmów (NOVA): identyfikacja 35 izolatów klinicznych reprezentujących potencjalnie nowe taksony bakteryjne przy użyciu rurociągu opartego na sekwencjonowaniu całego genomu. BMC Mikrobiol. 2024;24(1):14. doi: 10.1186/s12866-023-03163-7
Artykuł ten został ponownie opublikowany na podstawie następujących materiałów. Uwaga: materiał mógł zostać zmieniony pod względem długości i treści. Aby uzyskać więcej informacji, skontaktuj się z cytowanym źródłem.
