Zespół badań klinicznych z Wydziału Pediatrii i Medycyny Młodzieży oraz Oddziału Położnictwa i Ginekologii Szkoły Medycyny Klinicznej Wydziału Lekarskiego LKS Uniwersytetu w Hongkongu (HKUMed) prowadzi odkrycie zastosowania komórek płynu owodniowego uzyskanych podczas 16- 24 tydzień ciąży jako nowy typ próbki do sekwencjonowania RNA w diagnostyce prenatalnej, aby pomóc większej liczbie rodzin w dostosowanym postępowaniu klinicznym. Jest to pierwsze w literaturze badanie potwierdzające słuszność koncepcji, które wykazuje potencjalną użyteczność kliniczną sekwencjonowania RNA komórek płynu owodniowego. Przełomowe odkrycia zostały opublikowane w czołowym czasopiśmie naukowym pt. npj Medycyna genomowa.

Tło

Rzadkie choroby mają zwykle podłoże genetyczne. Chociaż pojedynczo rzadkie, na podstawie wcześniejszych badań zespołu stwierdzono, że choroby rzadkie łącznie występują u 1 na 67 mieszkańców Hongkongu. Identyfikacja przyczyny genetycznej w rzadkich chorobach może zapewnić dokładne doradztwo w celu lepszego zarządzania klinicznego i planowania przyszłej ciąży, co jest niezbędne do wspierania pacjentek. Obecne technologie diagnostyki prenatalnej są w dużej mierze oparte na DNA, a duża część (60-70%) pozostaje niezdiagnozowana, co prowadzi do niepewności klinicznej i niepokoju rodziców. Ostatnio stwierdzono, że sekwencjonowanie RNA zwiększa wydajność diagnostyczną o 10% do 36%, jednak żadne z tych badań nie koncentrowało się na diagnostyce prenatalnej. Ponadto, pomimo dostępności dobrze ugruntowanej dużej bazy danych katalogującej profil ekspresji genów różnych tkanek dla dorosłych, brakuje podobnego publicznie dostępnego zestawu danych dla komórek płynu owodniowego, odzwierciedlającego etap embriologiczny i płodowy. Konieczne są zatem dalsze badania i badania nad sekwencjonowaniem RNA w warunkach prenatalnych.

Wyniki badań

Zespół badawczy wykazał potencjalną przydatność kliniczną sekwencjonowania RNA komórek płynu owodniowego. Punkt odniesienia dla profilu ekspresji genów w komórkach płynu owodniowego ustalono przez wykonanie sekwencjonowania RNA na ponad 50 próbkach płynu owodniowego. Ustalenie profilu ekspresji genów jest niezbędnym krokiem w zastosowaniu sekwencjonowania RNA do obecnie wybranego przepływu pracy w diagnostyce klinicznej. Naukowcy odkryli, że liczba dobrze eksprymowanych genów w komórkach płynu owodniowego była porównywalna z innymi dostępnymi klinicznie tkankami powszechnie używanymi do diagnostyki genetycznej różnych kategorii chorób. Zespół badawczy porównał również dane sekwencjonowania RNA czterech płodów dotkniętych chorobą z wrodzonymi anomaliami strukturalnymi z ustaloną wartością bazową, aby wykryć potencjalne wartości odstające. We współpracy z Uniwersytetem Technicznym w Monachium w Niemczech dostosowano potok bioinformatyczny, aby usprawnić wykrywanie wartości odstających do późniejszej analizy. Dalsza dogłębna analiza wykazała, że ​​wartości odstające można zidentyfikować w genach związanych z odpowiednimi wrodzonymi anomaliami strukturalnymi u wszystkich czterech dotkniętych płodów. Identyfikacja wartości odstających dostarcza więcej dowodów na poziomie RNA, aby pomóc w postawieniu diagnozy.

Znaczenie badania

Wyniki tego badania mają istotne implikacje dla rozwiązywania niezdiagnozowanych rzadkich chorób w Hongkongu. Po raz pierwszy w literaturze stwierdzono, że sekwencjonowanie RNA komórek płynu owodniowego zapewnia potencjalną użyteczność kliniczną w diagnostyce prenatalnej. Dzięki identyfikacji przyczyny genetycznej możliwa jest medycyna precyzyjna, taka jak dostosowane postępowanie kliniczne i preimplantacyjna diagnostyka genetyczna dla rodzin z wywiadem rodzinnym.

Badanie to zostało wybrane jako „Reviewers’ Choice Abstract” na dorocznym spotkaniu American Society of Human Genetics (ASHG) 2022, jednej z największych konferencji tego rodzaju, na której wybierani są naukowcy z całego świata, aby zaprezentować swoje nowatorskie wspólne wyniki badań. „To zaszczyt, że plakat HKUMed został wybrany i oceniony jako 10% najlepszych streszczeń plakatów na tej prestiżowej międzynarodowej konferencji. Sekwencjonowanie RNA ma ogromny potencjał w rozwiązywaniu niewyjaśnionych zaburzeń genetycznych. Będziemy nadal wzmacniać powiązania i współpracę z instytucjami w Hong Kong i za granicą, przyczyniają się do międzynarodowych badań naukowych i przynoszą korzyści naszym lokalnym pacjentom” – powiedział dr Brian Chung Hon-yin, genetyk kliniczny, profesor nadzwyczajny, Wydział Pediatrii i Medycyny Młodzieży, Szkoła Medycyny Klinicznej, HKUMed.

Dr Anita Kan Sik-yau, honorowy profesor kliniczny, Wydział Położnictwa i Ginekologii, Wydział Medycyny Klinicznej, HKUMed i Zastępca Dyrektora Laboratorium Laboratorium Diagnostyki Prenatalnej Szpitala Tsan Yuk, dodała: „Z pamiętnej okazji szpitala Tsan Yuk ( TYH) z okazji 100. rocznicy, badanie to wykazało wyjątkową służbę TYH dla Hongkongu w ciągu ostatniego stulecia i ciągłe wysiłki na rzecz wszystkich potrzebujących, wraz z innowacyjnymi badaniami”.

Odniesienie: Lee M, Kwong AKY, Chui MMC i in. Potencjał diagnostyczny transkryptomu komórek płynu owodniowego w rozszyfrowywaniu choroby Mendla: dowód słuszności koncepcji. npj Genom Med. 2022;7(1):74. doi: 10.1038/s41525-022-00347-4

Ten artykuł został ponownie opublikowany z następujących materiałów. Uwaga: materiał mógł zostać zredagowany pod względem długości i treści. Aby uzyskać więcej informacji, skontaktuj się z cytowanym źródłem.