Dziękuję. Posłuchaj tego artykułu, korzystając z odtwarzacza powyżej. ✖

U około 40% osób, u których zdiagnozowano raka jelita grubego (CRC), guz niesie ze sobą mutację w genie zwanym KRAS. Wiele z tych mutacji powiązano z krótszym przeżyciem i bardziej agresywnymi postaciami choroby. Pojawienie się i rozwój nowotworów CRC również powiązano z brakiem równowagi w mikrobiomie jelitowym, ale wzajemne oddziaływanie tych dwóch cech – dysbiozy jelitowej i mutacji KRAS – pozostaje słabo poznane.

W badaniu opublikowanym w tym tygodniu w Spektrum mikrobiologii, czasopiśmie o otwartym dostępie wydawanym przez Amerykańskie Towarzystwo Mikrobiologii, badacze z Chin zidentyfikowali sygnatury mikroflory powiązane z mutacjami KRAS u osób, u których zdiagnozowano raka jelita grubego. Według Zigui Huanga, studenta medycyny w szpitalu onkologicznym Uniwersytetu Medycznego w Guangxi, który pracował nad badaniem, odkrycia sugerują, że drobnoustroje jelitowe mogą służyć jako rodzaj nieinwazyjnego biomarkera służącego do identyfikacji podtypów CRC i mogą pomóc w spersonalizowanym podejściu do terapii.

Badanie prowadził onkolog Weizhong Tang z tego samego szpitala, którego badania skupiały się na wykorzystaniu wiedzy molekularnej na temat CRC w celu lepszej diagnozy i leczenia tej choroby. „Nasza nowa praca przyczynia się do gromadzenia coraz większej liczby dowodów podkreślających znaczenie mechanizmów opartych na mikroflorze w patogenezie raka” – powiedział Tang.

Według Światowej Organizacji Zdrowia co roku u prawie 2 milionów ludzi na świecie diagnozuje się raka jelita grubego, a ponad 900 000 umiera z powodu tej choroby. W skali globalnej jest to trzeci najczęstszy nowotwór i druga najczęstsza przyczyna zgonów z powodu nowotworu. Poprzednie badania powiązały brak równowagi bakteryjnej jelit z powstawaniem i rozprzestrzenianiem się CRC, co sugeruje, że bliższe badanie populacji drobnoustrojów jelitowych w kontekście CRC może dostarczyć nowych informacji na temat diagnozy i leczenia.

„Zrozumienie specyficznych powiązań między różnymi typami mutacji KRAS i CRC jest istotne z kilku powodów” – powiedział Huang. Obejmują one wyjaśnienie mechanizmów molekularnych napędzających rozwój CRC i identyfikację biomarkerów potrzebnych do diagnozy i postępu choroby.

Na potrzeby nowego badania naukowcy przeanalizowali próbki kału od 94 osób chorych na CRC, stosując sekwencjonowanie 16s rRNA. Spośród 94 24 miało mutacje w genie KRAS, a reszta miała „typ dziki”, czyli niezmutowaną formę genu.

Sekwencjonowanie ujawniło 26 różnych typów mikroflory jelitowej, które występowały w jednej grupie, ale nie w drugiej. Rodzaje Fusobakteria, Clostridium I Shewanella wszystkie były liczne w grupie mutantów. Fusobakteria to Gram-ujemny drobnoustrój występujący w przewodzie pokarmowym i jamie ustnej, a poprzednie badania powiązały go z rozwojem CRC. Naukowcy zauważyli, że wszystkie trzy z nich należy uznać za nieinwazyjne biomarkery umożliwiające określenie statusu KRAS u pacjenta.

Bifidobakterie I Akkermansia były obfite w próbkach od pacjentów bez mutacji KRAS. Bifidobakterie jest probiotykiem i Akkermansia wykazał w poprzednich badaniach pewne działanie probiotyczne, w tym tłumienie czynników prozapalnych w okrężnicy. Na podstawie tego odkrycia naukowcy spekulują, że obecność tych bakterii może zmniejszyć ryzyko wystąpienia mutacji KRAS i w pewnym stopniu spowolnić postęp CRC.

W tym samym artykule naukowcy przedstawili model uczenia maszynowego, który mógłby wykorzystać te informacje do opracowania spersonalizowanych zaleceń dotyczących leczenia w oparciu o sygnatury mikrobioty. Huang powiedział jednak, że aby poprawić swoją skuteczność, model wymaga danych z większej kohorty. Grupa planuje przeprowadzić większe badania w celu potwierdzenia wyników i lepszego zrozumienia znaczenia zidentyfikowanej mikroflory jelitowej w nadziei na poprawę leczenia pacjentów z CRC.

„To badanie wpisuje się w nasz szerszy nacisk na zrozumienie skomplikowanych zależności między mutacjami genetycznymi, mikrośrodowiskiem nowotworu i mikroflorą jelitową w przypadku raka jelita grubego” – powiedział Tang.

Odniesienie: Huang Z, Huang X, Huang Y i in. Identyfikacja mikroflory jelitowej związanej z mutacją KRAS w raku jelita grubego i konstrukcja predykcyjnego modelu uczenia maszynowego. Navarathna DH, wyd. Spektrum Mikrobiologii 2024:e02720-23. doi: 10.1128/widmo.02720-23

Artykuł ten został ponownie opublikowany na podstawie następujących materiałów. Uwaga: materiał mógł zostać zmieniony pod względem długości i treści. Aby uzyskać więcej informacji, skontaktuj się z cytowanym źródłem.