Z badań opublikowanych w czasopiśmie „Badania” wynika, że ​​szacunkowa częstość występowania choroby von Willebranda (VWD) na podstawie szeroko zakrojonych danych genetycznych jest znacznie wyższa niż oczekiwano. Medycyna genomowa NPJ.

„Według wcześniejszych badań szacuje się, że częstość występowania VWD waha się od 0,6% do 1,3%, mimo że na podstawie przypadków kierowanych do wyspecjalizowanych ośrodków szacuje się, że u około 1 przypadku na 1000 osób występuje klinicznie istotna choroba VWD” – napisali autorzy badania w swoim badaniu. raport. „Mimo to rzeczywista częstość występowania VWD nie została dokładnie ustalona ze względu na brak prospektywnych i systematycznych badań oraz fakt, że niektórzy pacjenci z wariantami VWF nie mają objawów lub mają łagodne objawy kliniczne”.

Naukowcy oszacowali częstość występowania dziedzicznej choroby VWD na całym świecie i w obrębie populacji, analizując dane dotyczące egzomu i genomu w bazie danych agregacji genomu (gnomAD). Przeszukali także inne bazy danych zawierające warianty VWF, takie jak baza danych Leiden Open Variation Database i baza danych mutacji genów ludzkich, aby zbadać globalne spektrum mutacji VWD.

Kontynuuj czytanie

Do badania włączono dane od 141 456 osób chorych na gnomAD, a w ramach analizy zidentyfikowano 4313 wariantów VWF. Przewidywano, że łącznie 505 wariantów będzie patogennych lub już zgłoszono, że są powiązane z VWD, a spośród nich 244 (48%) było unikalnych, a każdy wariant zidentyfikowano tylko u jednego uczestnika. Warianty patogenne dotyczyły 31 785 z 282 912 analizowanych alleli.

Badacze oszacowali częstość występowania alleli gnomAD niosących patogenne warianty VWF w stanie heterozygotycznym na 13,9% i na 0,48% w stanie recesywnym, przy czym podobne szacunki uwzględniają jedynie zgłoszone warianty VWF.

Globalna częstość występowania dominującej choroby VWD wynosiła 74 na 1000 osób dla typu 1, 3 dla 2A, 3 dla 2B i 6 dla 2M. W przypadku recesywnych postaci choroby VWD na świecie częstość występowania wynosiła 0,31 na 1000 osób dla typu 2N i 0,7 na 1000 osób dla typu 3.

„Nasze badanie pokazuje, że częstość występowania domniemanych alleli chorobotwórczych i wariantów VWF powiązanych z VWD jest znacznie większa niż oczekiwano. Odkrycie to sugeruje, że duża liczba pacjentów z VWD jest być może nadal niezdiagnozowana i dlatego tak jest [undertreated]” – podsumowują autorzy badania.

Ograniczenia badania obejmowały potencjalne fałszywie pozytywne przewidywanie patogeniczności wariantów VWF za pomocą algorytmów in silico, możliwy nierozpoznawanie promotora, głębokiej introny, wariantów insercji i delecji przez programy wywołujące warianty, potencjalne niewykryte delecje i rearanżacje w danych sekwencjonowania egzomu oraz brak VWF dostępne pomiary osocza w celu potwierdzenia wariantu patogeniczności.

Ujawnienie: Jeden z autorów badania zadeklarował powiązania z firmami biotechnologicznymi, farmaceutycznymi lub produkującymi urządzenia. Pełną listę ujawnień autorów można znaleźć w oryginalnym odnośniku.

Odniesienie

Seidizadeh O, Cairo A, Baronciani L, Valenti L, Peyvandi F. Częstość występowania populacyjna i krajobraz mutacyjny choroby von Willebranda przy użyciu wielkoskalowych genetycznych baz danych. NPJ Genom Med. 2023;8(1):31. doi:10.1038/s41525-023-00375-8