Nauka i technika

Zamiłowanie do biologii morza i analizy danych

  • 9 maja, 2024
  • 3 min read
Zamiłowanie do biologii morza i analizy danych


Miłość Kelsey Beavers do oceanu zaczęła się w młodym wieku. Pochodząca z rodziny zapalonych płetwonurków, w wieku 11 lat została certyfikowanym młodszym nurkiem.

„To był inny świat” – powiedział Beavers. „Podobało mi się wszystko, co dotyczy oceanu.”

Po ukończeniu szkoły średniej mieszkaniec Austin przeprowadził się do Fort Worth, aby studiować nauki o środowisku na Texas Christian University. Jeden z jej profesorów na TCU znał profesor biologii Uniwersytetu Teksasu w Arlington Laurę Mydlarz i zachęcał Beavers do kontynuowania studiów w Arlington.

„Kelsey przyjechała do UTA, aby zrobić doktorat. i badała choroby koralowców, po czym szybko zaangażowała się w duży projekt dotyczący utraty tkanki koralowców kamiennych (SCTLD), szybko rozprzestrzeniającej się choroby, która zabija korale na całym wybrzeżu Florydy oraz w 22 krajach Karaibów” – powiedział Mydlarz. „Była prawdziwym nabytkiem dla naszego zespołu, w tym była główną autorką artykułu na temat tej choroby, który opublikowaliśmy w zeszłym roku w Nature Communications”.

W ramach programu doktoranckiego Beavers ukończyła oryginalne badania dotyczące ekspresji genów raf koralowych dotkniętych SCTLD. Jej badania obejmowały nurkowanie u wybrzeży Wysp Dziewiczych Stanów Zjednoczonych w celu pobrania próbek tkanki koralowców przed powrotem do laboratorium w celu analizy danych.

Warto przeczytać!  Ewolucja wyjątkowo ludzkiego DNA była delikatnym aktem równoważenia

„Odkryliśmy, że SCTLD wpływa również na symbiotyczne glony żyjące w koralowcach” – powiedział Beavers. „Nasza obecna hipoteza głosi, że glony przemieszczające się z rafy na rafę mogą rozprzestrzeniać chorobę, która niszczy rafy koralowe od chwili jej pojawienia się w 2014 roku”.

Duża część projektu rozprawy doktorskiej Beavers polegała na analizie dużych zestawów danych dotyczących ekspresji genów wyodrębnionych z próbek koralowców i przeanalizowaniu ich w kontekście podatności i ciężkości chorób.

„Część analityczna projektu obejmowała znacznie więcej niż tylko użycie zwykłego komputera Mac, dlatego współpracowałem z Texas Advanced Computer Center (TACC) w Austin, które jest częścią UT System, korzystając z ich superkomputerów” – powiedział Beavers.

Beavers tak bardzo spodobała się część projektu obejmująca analizę danych, że kiedy zobaczyła wakat w TACC na stanowisko na pełny etat, natychmiast skorzystała z okazji. Obecnie pracuje tam na pół etatu aż do ukończenia studiów, kiedy to planuje przeprowadzić się do Austin na nowe stanowisko.

„Nie mogę się doczekać nowego stanowiska, ponieważ będę mogła pracować nad projektami badawczymi innymi niż mój własny” – powiedziała. „Byłoby ciekawie zostać specjalistą w dziedzinie analizy danych i pomagać innym naukowcom w korzystaniu z superkomputerów TACC do rozwiązywania złożonych problemów”.

Warto przeczytać!  Dodatkowe palce u rąk i nóg? Naukowcy wskazują genetycznego winowajcę

W ramach swojej pracy będzie podróżować do innych kampusów UT System, aby kształcić badaczy w zakresie sposobów korzystania z narzędzi dostępnych w TACC.

„Jestem naprawdę dumny z pracy, którą Kelsey wykonała w naszym laboratorium przez ostatnie kilka lat, i nie mogę się doczekać, jak będzie się rozwijać po ukończeniu studiów” – powiedział Mydlarz. „Widzenie, jak moi uczniowie odnoszą sukcesy, to jedna z najlepszych części tej pracy”.

Zastrzeżenie: AAAS i EurekAlert! nie odpowiadają za dokładność komunikatów prasowych publikowanych w EurekAlert! przez instytucje wnoszące wkład lub za wykorzystanie jakichkolwiek informacji za pośrednictwem systemu EurekAlert.


Źródło