Zidentyfikowano nowego kandydata na gen podatności na raka piersi
![Zidentyfikowano nowego kandydata na gen podatności na raka piersi](https://oen.pl/wp-content/uploads/2023/03/cancer-gene-770x470.jpg)
Artykuł opublikowany w American Journal of Human Genetics proponuje warianty genu ATRIP jako kandydata na gen podatności na raka piersi w oparciu o badanie kobiet bez żadnego ze znanych wariantów genów związanych z rakiem piersi.
Zespół kanadyjskich i polskich naukowców kierowany przez University of Toronto zebrał dane dotyczące 510 kobiet z Polski z silną historią raka piersi w rodzinie, ale bez potwierdzonego genu o umiarkowanej lub wysokiej podatności na raka piersi.
Przeprowadzono sekwencjonowanie całego egzomu i wybrano geny z potwierdzoną utratą wariantów funkcji do analiz asocjacyjnych. Ograniczyli ten kolejny krok w analizie do genów, o których wiadomo, że odgrywają rolę w patogenezie raka i tych z wariantem nawracającej utraty funkcji. To zawęziło listę do dziewięciu interesujących genów, z których najczęstszym był ATRIP.
Spośród 510 kobiet z rakiem piersi i bez potwierdzonych genów podatności, 3 miało warianty utraty funkcji ATRIP. W grupie kontrolnej 308 osób żaden nie wykazywał zmodyfikowanego ATRIP. Było to z pozoru nieistotne odkrycie samo w sobie, dopóki nie porównano go z poprzednim badaniem genomicznym, które wykazało częstotliwość utraty wariantów funkcji ATRIP wśród 22 928 wolnych od raka europejskich kobiet spoza Finlandii, gdzie warianty dotyczyły tylko 1 na 2293 kobiet.
Następnie zespół zwrócił się do większego zestawu danych, aby zbadać wstępne odkrycie. W większej grupie 16 085 Polek z niewyselekcjonowanym rakiem piersi i 9 285 kobiet zdrowych w fazie walidacji, wariant ATRIP wykryto u 42 z 16 085 kobiet dotkniętych chorobą (1 na 383 kobiet z rakiem piersi) w porównaniu z 11 z 9 285 pacjentek z grupy kontrolnej ( 1 na 844 osoby).
ATRIP to krok w znacznie szerszym obrazie naprawy DNA. Większość dziedzicznych genów związanych z rakiem piersi (15 znanych jako geny o umiarkowanym lub wysokim ryzyku) jest częścią tego systemu naprawy DNA. Utrata funkcji lub zmutowany wariant któregokolwiek z nich zwiększa ryzyko zachorowania na raka piersi. Większość kobiet ma pewne czynniki ryzyka, ale nie choruje na raka piersi. Około 13% kobiet rozwinie się w pewnym momencie, z czego mniej niż 10% można przypisać przyczynom dziedzicznym.
Chociaż potencjalna rola ATRIP może być niewielka w ogólnej liczbie przypadków, każdy przypadek raka, który można zawęzić do mechanizmu przyczynowego, pomaga w prognozowaniu klinicznym i profilaktyce. Odkrycie wcześniej nieznanego czynnika ryzyka w tym badaniu jest teraz punktem wyjścia do następnego, ponieważ potrzebne są dalsze badania, aż do znalezienia lekarstwa.
Więcej informacji:
Cezary Cybulski i wsp., Warianty w ATRIP są związane z podatnością na raka piersi w populacji polskiej i UK Biobank, American Journal of Human Genetics (2023). DOI: 10.1016/j.ajhg.2023.03.002
Informacje o czasopiśmie:
American Journal of Human Genetics
© 2023 Sieć Science X